More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0030 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  70.18 
 
 		 600 aa  826    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 597 aa  1181    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 589 aa  553  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 		 588 aa  543  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  46.44 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 592 aa  536  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  46.62 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  46.24 
 
 		 602 aa  522  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 589 aa  502  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  42.62 
 
 		 604 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  41.72 
 
 		 593 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 598 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  42.74 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  41.16 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  41.65 
 
 		 593 aa  488  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  40.34 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  41.58 
 
 		 593 aa  484  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  41.58 
 
 		 597 aa  481  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  44.48 
 
 		 598 aa  482  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  41.5 
 
 		 607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 		 604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  41.92 
 
 		 602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  38.97 
 
 		 1228 aa  403  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  38.96 
 
 		 1072 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  38 
 
 		 997 aa  369  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  36.46 
 
 		 623 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  34.72 
 
 		 599 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  33.69 
 
 		 658 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  28.07 
 
 		 908 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  28.25 
 
 		 908 aa  160  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 		 693 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  28.25 
 
 		 690 aa  156  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  31.6 
 
 		 970 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 829 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  31.68 
 
 		 692 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  31.7 
 
 		 914 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  31.29 
 
 		 854 aa  153  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  28.04 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  29.05 
 
 		 822 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  28.01 
 
 		 739 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  27.67 
 
 		 732 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  30.36 
 
 		 995 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  27.01 
 
 		 905 aa  151  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0522  translation initiation factor IF-2  28.99 
 
 		 779 aa  150  8e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  30.19 
 
 		 999 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  28.52 
 
 		 924 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  30.35 
 
 		 962 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  29.81 
 
 		 882 aa  148  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  31.3 
 
 		 848 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 997 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  29.14 
 
 		 928 aa  146  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  27.19 
 
 		 904 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  28.08 
 
 		 692 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 964 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 966 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  31.42 
 
 		 843 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  28.65 
 
 		 887 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  30.79 
 
 		 834 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  30.24 
 
 		 951 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  29.27 
 
 		 927 aa  145  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  30.24 
 
 		 946 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  30.24 
 
 		 950 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  30.06 
 
 		 679 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  30.06 
 
 		 679 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  27.67 
 
 		 883 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 896 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  28.06 
 
 		 964 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  26.78 
 
 		 876 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  29.27 
 
 		 968 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 752 aa  144  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  28.42 
 
 		 979 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  30.7 
 
 		 887 aa  144  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  29.25 
 
 		 614 aa  144  6e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  29.85 
 
 		 700 aa  143  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  29.25 
 
 		 689 aa  144  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  29.85 
 
 		 1058 aa  143  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  28.72 
 
 		 917 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  26.86 
 
 		 965 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  27.6 
 
 		 922 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  27.69 
 
 		 1161 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  29.42 
 
 		 874 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  27.75 
 
 		 894 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  26.83 
 
 		 948 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.91 
 
 		 903 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  30.15 
 
 		 856 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  30.8 
 
 		 848 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  30.87 
 
 		 888 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  27.79 
 
 		 875 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  30.74 
 
 		 981 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  27.86 
 
 		 972 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  27.79 
 
 		 875 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  30.87 
 
 		 824 aa  141  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  30.43 
 
 		 835 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  29.06 
 
 		 943 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>