More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0223 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  68.02 
 
 		 591 aa  856    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 		 597 aa  642    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  53.64 
 
 		 591 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 591 aa  1197    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 589 aa  641    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  60.48 
 
 		 602 aa  740    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  52.46 
 
 		 599 aa  647    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 593 aa  680    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  51.78 
 
 		 607 aa  634  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  54.45 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 604 aa  619  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 593 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 604 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 		 602 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  48.58 
 
 		 598 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 598 aa  561  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  47.91 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 		 598 aa  537  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  44.59 
 
 		 600 aa  486  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 		 597 aa  486  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  42.37 
 
 		 588 aa  487  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  42.83 
 
 		 601 aa  482  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  41.89 
 
 		 592 aa  478  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  42.61 
 
 		 594 aa  478  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  43.6 
 
 		 593 aa  475  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  43.2 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  41.94 
 
 		 592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  37.2 
 
 		 623 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  36.61 
 
 		 1072 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39.77 
 
 		 1228 aa  364  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  34.27 
 
 		 997 aa  327  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  33.16 
 
 		 599 aa  319  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  29.35 
 
 		 1059 aa  183  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.65 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  30.53 
 
 		 838 aa  182  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  29.15 
 
 		 689 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  29.91 
 
 		 739 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  30.26 
 
 		 924 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 686 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  31.24 
 
 		 903 aa  179  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 732 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  29.3 
 
 		 880 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  31.1 
 
 		 882 aa  179  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 686 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 686 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  32.82 
 
 		 822 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  31.37 
 
 		 1104 aa  178  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 686 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 686 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 686 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 686 aa  177  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 		 1042 aa  176  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  31.98 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  29.7 
 
 		 903 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  32.33 
 
 		 834 aa  176  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 688 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  32.45 
 
 		 1176 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 		 692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  30.76 
 
 		 689 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  30.42 
 
 		 927 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  30.58 
 
 		 908 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  29.69 
 
 		 720 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 1183 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  31.48 
 
 		 887 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  30.97 
 
 		 888 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  29.43 
 
 		 877 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  32.83 
 
 		 848 aa  174  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  30.37 
 
 		 970 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  28.8 
 
 		 688 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  31.89 
 
 		 949 aa  173  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  29.68 
 
 		 921 aa  173  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  30.27 
 
 		 1183 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  32.59 
 
 		 885 aa  173  9e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  32.25 
 
 		 985 aa  173  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  30.15 
 
 		 1124 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  32.4 
 
 		 876 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  32.61 
 
 		 856 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  31.01 
 
 		 943 aa  172  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  31.82 
 
 		 879 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  31.68 
 
 		 992 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  29.48 
 
 		 856 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  31.68 
 
 		 992 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 		 1113 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  30.39 
 
 		 656 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  29.75 
 
 		 917 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  29.75 
 
 		 917 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  31.67 
 
 		 843 aa  171  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  31.52 
 
 		 679 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  31.52 
 
 		 679 aa  171  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  31.04 
 
 		 854 aa  170  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  29.47 
 
 		 886 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  30.33 
 
 		 965 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  31.04 
 
 		 871 aa  170  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  29.97 
 
 		 883 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  32.97 
 
 		 998 aa  170  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  30.82 
 
 		 914 aa  170  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  31.04 
 
 		 871 aa  170  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  30.06 
 
 		 705 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  30.04 
 
 		 908 aa  169  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>