More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2060 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  74.5 
 
 		 602 aa  864    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  71.77 
 
 		 604 aa  837    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  73.99 
 
 		 599 aa  900    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 597 aa  1193    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 		 591 aa  654    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  74.36 
 
 		 607 aa  885    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 602 aa  628  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 593 aa  598  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  47.91 
 
 		 593 aa  588  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 		 589 aa  587  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 604 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  46.87 
 
 		 591 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  49.32 
 
 		 578 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 598 aa  555  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  46.15 
 
 		 598 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  45.65 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  46.49 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  45.56 
 
 		 598 aa  531  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 		 597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  41.58 
 
 		 600 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  41.96 
 
 		 589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  40.78 
 
 		 588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  40.07 
 
 		 593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  40 
 
 		 601 aa  444  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  40.78 
 
 		 592 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  41.19 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.23 
 
 		 1072 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  37.16 
 
 		 599 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.12 
 
 		 623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39.21 
 
 		 1228 aa  352  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  35.52 
 
 		 997 aa  337  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  31.05 
 
 		 908 aa  208  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  30.88 
 
 		 908 aa  208  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  29.73 
 
 		 905 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  31.34 
 
 		 688 aa  198  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 		 686 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 		 686 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 		 686 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 		 686 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  31.16 
 
 		 686 aa  197  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  31.16 
 
 		 688 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  31.08 
 
 		 689 aa  194  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 903 aa  194  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.55 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  30.66 
 
 		 848 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  31.15 
 
 		 822 aa  187  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  30.63 
 
 		 979 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  31.93 
 
 		 949 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  31.22 
 
 		 966 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  30.47 
 
 		 732 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  28.52 
 
 		 692 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  30.35 
 
 		 920 aa  183  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  30.77 
 
 		 845 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  29.74 
 
 		 927 aa  182  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  29.44 
 
 		 658 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 964 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  30.37 
 
 		 868 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 		 904 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  29.37 
 
 		 888 aa  181  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  30.23 
 
 		 965 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  30.43 
 
 		 689 aa  181  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  29.68 
 
 		 964 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 1128 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 602 aa  180  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  29.67 
 
 		 739 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  29.18 
 
 		 1042 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  28.77 
 
 		 1030 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  28.8 
 
 		 885 aa  179  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  30.71 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  30.71 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  28.8 
 
 		 838 aa  179  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  30.32 
 
 		 992 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.36 
 
 		 601 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  29.89 
 
 		 882 aa  179  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  30.32 
 
 		 992 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  30.12 
 
 		 903 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  28.83 
 
 		 1059 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  29.48 
 
 		 1104 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 		 1183 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 		 686 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 972 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 		 1183 aa  177  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  29.95 
 
 		 924 aa  177  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  29.48 
 
 		 1176 aa  177  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  29 
 
 		 917 aa  177  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  28.07 
 
 		 673 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 		 853 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  27.94 
 
 		 1161 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  28.67 
 
 		 968 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  28.32 
 
 		 914 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0667  translation initiation factor IF-2  29.46 
 
 		 826 aa  174  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560866 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  29.06 
 
 		 705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  29.06 
 
 		 705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  30.28 
 
 		 989 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  29.88 
 
 		 971 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>