More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0339 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  63.42 
 
 		 589 aa  781    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 593 aa  1208    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  67.97 
 
 		 604 aa  825    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  73.08 
 
 		 591 aa  911    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  68.58 
 
 		 593 aa  845    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 		 602 aa  643    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 591 aa  624  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  50 
 
 		 578 aa  593  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  48.81 
 
 		 599 aa  586  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  47.91 
 
 		 597 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  48.07 
 
 		 607 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 604 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 602 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 		 598 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  46.49 
 
 		 598 aa  531  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  45.58 
 
 		 598 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 		 598 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  45.09 
 
 		 598 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  41.58 
 
 		 597 aa  472  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  41.82 
 
 		 600 aa  464  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  41.32 
 
 		 593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  40.68 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  41.02 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  41.27 
 
 		 601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  40.75 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  40.2 
 
 		 592 aa  437  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  40.31 
 
 		 594 aa  422  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39 
 
 		 1228 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.88 
 
 		 623 aa  355  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  36.53 
 
 		 1072 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  37.95 
 
 		 997 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  33.85 
 
 		 599 aa  310  5e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  29.35 
 
 		 882 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  30.18 
 
 		 951 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 946 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.61 
 
 		 903 aa  178  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 		 692 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  31.35 
 
 		 903 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  30.69 
 
 		 950 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  30.82 
 
 		 658 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.43 
 
 		 838 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 970 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 705 aa  174  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 686 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  28.81 
 
 		 693 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 705 aa  174  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  29.7 
 
 		 924 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  28.81 
 
 		 690 aa  173  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 992 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 992 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  30.04 
 
 		 822 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  30.33 
 
 		 905 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  30.54 
 
 		 908 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  30.19 
 
 		 908 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  30.67 
 
 		 845 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 732 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  32.54 
 
 		 885 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  30.38 
 
 		 887 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  29.73 
 
 		 880 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 1128 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 1104 aa  170  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 985 aa  170  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  29.48 
 
 		 921 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  31.8 
 
 		 679 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  31.8 
 
 		 679 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 1176 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 739 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  30.28 
 
 		 914 aa  169  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  28.85 
 
 		 601 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  28.85 
 
 		 1161 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33386  mitochondrial translation initiation factor 2  33.11 
 
 		 683 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  31.3 
 
 		 1131 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  31.28 
 
 		 992 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  30.31 
 
 		 912 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  29.53 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 868 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 		 689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 688 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  31.42 
 
 		 876 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  29.91 
 
 		 871 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  29.53 
 
 		 883 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  30.43 
 
 		 854 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  29.82 
 
 		 894 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  30.09 
 
 		 848 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  29.6 
 
 		 883 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  28.85 
 
 		 1114 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  29.36 
 
 		 886 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 853 aa  163  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  28.85 
 
 		 1126 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  29.28 
 
 		 1113 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 835 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 		 711 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 		 688 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>