More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33386 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_33386  mitochondrial translation initiation factor 2  100 
 
 		 683 aa  1355    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 		 887 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  40.69 
 
 		 889 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  40.89 
 
 		 894 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  43.25 
 
 		 883 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  46.38 
 
 		 903 aa  429  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  43.12 
 
 		 835 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  41.36 
 
 		 896 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  40.65 
 
 		 885 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  42.21 
 
 		 853 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 912 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 		 884 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  45.76 
 
 		 895 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  45.1 
 
 		 883 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  40.81 
 
 		 904 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  41.91 
 
 		 896 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 		 898 aa  422  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  41.51 
 
 		 980 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  40.32 
 
 		 824 aa  422  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  41.61 
 
 		 902 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  41.78 
 
 		 894 aa  422  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  42.49 
 
 		 856 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2815  translation initiation factor IF-2  41.6 
 
 		 883 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  40.58 
 
 		 897 aa  422  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  43.54 
 
 		 899 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  41.84 
 
 		 880 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  45.56 
 
 		 885 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  41.1 
 
 		 705 aa  419  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  41.57 
 
 		 892 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  41.1 
 
 		 705 aa  419  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  43.2 
 
 		 836 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  43.37 
 
 		 836 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  43.37 
 
 		 905 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  47.14 
 
 		 900 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  41.84 
 
 		 880 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  41.84 
 
 		 880 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 884 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  46.26 
 
 		 890 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  47.53 
 
 		 901 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  41.67 
 
 		 885 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  41.67 
 
 		 885 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  41.67 
 
 		 880 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  41.84 
 
 		 880 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  45.56 
 
 		 889 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  40.09 
 
 		 882 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  42.13 
 
 		 848 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  41.17 
 
 		 986 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  43.75 
 
 		 848 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  42.24 
 
 		 868 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  40.65 
 
 		 720 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  44.09 
 
 		 868 aa  415  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  42.25 
 
 		 975 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 892 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 892 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  40.98 
 
 		 924 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 892 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  40.68 
 
 		 989 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  40.85 
 
 		 917 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  43.9 
 
 		 845 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  42.13 
 
 		 926 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 884 aa  415  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 892 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 892 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 892 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  43.37 
 
 		 838 aa  416  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  44.07 
 
 		 843 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  41.64 
 
 		 984 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  41.57 
 
 		 892 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  40.41 
 
 		 861 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  40.24 
 
 		 832 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  40.68 
 
 		 989 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 892 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  43.61 
 
 		 1045 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  40.57 
 
 		 921 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  40.99 
 
 		 882 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  45.96 
 
 		 898 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  40.68 
 
 		 917 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  41.68 
 
 		 981 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  40.3 
 
 		 854 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  40.67 
 
 		 921 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 890 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  40.33 
 
 		 869 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  40.17 
 
 		 990 aa  412  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  41.68 
 
 		 887 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 		 886 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  41.04 
 
 		 971 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  41.06 
 
 		 885 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  39.23 
 
 		 992 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  40.37 
 
 		 891 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  42.33 
 
 		 945 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  40.65 
 
 		 822 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  44.16 
 
 		 881 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>