More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0669 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 598 aa  1206    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  95.82 
 
 		 598 aa  1169    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  95.65 
 
 		 598 aa  1167    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  74.92 
 
 		 598 aa  950    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  85.95 
 
 		 598 aa  1051    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  48.07 
 
 		 602 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  47.91 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  45.65 
 
 		 597 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  47 
 
 		 604 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  48.24 
 
 		 578 aa  540  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  45.58 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 		 593 aa  531  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  45.24 
 
 		 593 aa  524  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  46.24 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  44.74 
 
 		 591 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 589 aa  514  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  45.91 
 
 		 607 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  45.74 
 
 		 602 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  43.24 
 
 		 592 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 		 601 aa  487  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 592 aa  483  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  42.09 
 
 		 588 aa  481  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  42.42 
 
 		 589 aa  478  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  43.43 
 
 		 593 aa  473  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  42.95 
 
 		 600 aa  464  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  42.37 
 
 		 594 aa  465  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.47 
 
 		 599 aa  342  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.03 
 
 		 623 aa  339  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.21 
 
 		 1072 aa  339  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  34.92 
 
 		 1228 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  34.78 
 
 		 997 aa  315  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  32.94 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  32.94 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  32.94 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  33.27 
 
 		 732 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  32.94 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  32.14 
 
 		 705 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  32.94 
 
 		 686 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  32.14 
 
 		 705 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  32.74 
 
 		 688 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  32.14 
 
 		 686 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  32.14 
 
 		 686 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  32.07 
 
 		 689 aa  194  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  34.18 
 
 		 720 aa  193  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  32.94 
 
 		 688 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  33.98 
 
 		 658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  33.53 
 
 		 690 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  32.86 
 
 		 693 aa  190  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  32.05 
 
 		 692 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  33.26 
 
 		 711 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 601 aa  187  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  31.89 
 
 		 739 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  33.48 
 
 		 679 aa  185  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  33.48 
 
 		 679 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 1104 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  30.1 
 
 		 946 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  33.62 
 
 		 882 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  30.1 
 
 		 951 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 		 1176 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  31.23 
 
 		 673 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  29.68 
 
 		 992 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  29.68 
 
 		 992 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  32.2 
 
 		 985 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  30.84 
 
 		 949 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  30.78 
 
 		 822 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.36 
 
 		 970 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.35 
 
 		 571 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  29.89 
 
 		 1042 aa  178  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 950 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.44 
 
 		 1128 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 686 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  33.53 
 
 		 845 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  29.72 
 
 		 1113 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 879 aa  177  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 885 aa  176  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  29.46 
 
 		 1126 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 903 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 		 1183 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  31.99 
 
 		 992 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  30.91 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 1114 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  32.39 
 
 		 903 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  33 
 
 		 928 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  31.17 
 
 		 897 aa  174  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  31.88 
 
 		 1131 aa  174  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 1161 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 1124 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  30.08 
 
 		 1005 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  28.42 
 
 		 1059 aa  173  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  32.29 
 
 		 829 aa  173  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  31.87 
 
 		 1079 aa  173  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  29.26 
 
 		 1183 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  32.07 
 
 		 971 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  30.41 
 
 		 920 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  29.83 
 
 		 936 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  29.48 
 
 		 1030 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  32.62 
 
 		 950 aa  172  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  32.08 
 
 		 964 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>