More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1312 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  73.82 
 
 		 607 aa  878    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  73.01 
 
 		 599 aa  892    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 604 aa  1197    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  71.26 
 
 		 597 aa  859    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  80.5 
 
 		 602 aa  926    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 591 aa  622  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 591 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 593 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 602 aa  595  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 593 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 591 aa  593  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 589 aa  586  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 604 aa  587  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  47.28 
 
 		 578 aa  555  1e-156  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  46.74 
 
 		 598 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  46.24 
 
 		 598 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 		 598 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  43.41 
 
 		 598 aa  511  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  44.74 
 
 		 598 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  43.1 
 
 		 597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  41.58 
 
 		 600 aa  442  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  40.74 
 
 		 593 aa  445  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  41.96 
 
 		 589 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  41.55 
 
 		 588 aa  438  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  41.69 
 
 		 592 aa  435  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  41.05 
 
 		 592 aa  431  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  41.44 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.59 
 
 		 1072 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.19 
 
 		 623 aa  350  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  37.39 
 
 		 997 aa  345  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39.96 
 
 		 1228 aa  343  4e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.84 
 
 		 599 aa  335  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  30.05 
 
 		 1030 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 		 927 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  29.32 
 
 		 692 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  30.57 
 
 		 924 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  30.2 
 
 		 1104 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  29.84 
 
 		 705 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  30.74 
 
 		 905 aa  179  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  29.84 
 
 		 705 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  29.71 
 
 		 1176 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 1128 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  29.77 
 
 		 985 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 686 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 686 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 688 aa  177  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  29.74 
 
 		 688 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  31.47 
 
 		 979 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 686 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 686 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  29.89 
 
 		 1113 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 686 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 686 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 1183 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  31.32 
 
 		 966 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  30.24 
 
 		 908 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  30.58 
 
 		 848 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 1183 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  29.74 
 
 		 686 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 		 732 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  29.75 
 
 		 579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 		 593 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0667  translation initiation factor IF-2  29.72 
 
 		 826 aa  174  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560866 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  28.04 
 
 		 1161 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  30.43 
 
 		 995 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  29.9 
 
 		 908 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 689 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  29.39 
 
 		 593 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 		 1114 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 		 679 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 		 679 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  29.6 
 
 		 686 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  32.05 
 
 		 689 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  30.2 
 
 		 969 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 965 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  29.65 
 
 		 936 aa  171  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 601 aa  171  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  30.25 
 
 		 999 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  28.83 
 
 		 1124 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 854 aa  170  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  30.97 
 
 		 815 aa  170  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 		 992 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 		 992 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  31.27 
 
 		 904 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  28.1 
 
 		 571 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  28.19 
 
 		 943 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 975 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 975 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 975 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  30.71 
 
 		 928 aa  169  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 975 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  29.74 
 
 		 972 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 975 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  29.66 
 
 		 971 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  29.48 
 
 		 971 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 975 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.69 
 
 		 838 aa  169  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>