More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0457 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  58.93 
 
 		 589 aa  714    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 594 aa  1191    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 		 592 aa  696    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  57.8 
 
 		 592 aa  705    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  58.87 
 
 		 588 aa  718    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 601 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  45.22 
 
 		 602 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  46.48 
 
 		 600 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  45.64 
 
 		 578 aa  509  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  45.32 
 
 		 591 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  44.24 
 
 		 598 aa  496  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  42.61 
 
 		 591 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  42.37 
 
 		 598 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  42.71 
 
 		 598 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  42.54 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  43 
 
 		 593 aa  477  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  43.24 
 
 		 589 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 		 598 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  42.08 
 
 		 604 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  43.22 
 
 		 599 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  40.31 
 
 		 593 aa  465  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  41.2 
 
 		 591 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  41.36 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  40.31 
 
 		 593 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  40.85 
 
 		 607 aa  439  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  41.1 
 
 		 604 aa  418  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  41.02 
 
 		 602 aa  410  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  38.58 
 
 		 1228 aa  390  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  40.24 
 
 		 1072 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  39.15 
 
 		 599 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  36.78 
 
 		 623 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  38.26 
 
 		 997 aa  356  5.999999999999999e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  27.6 
 
 		 948 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  29.57 
 
 		 658 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  27.82 
 
 		 920 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  27.08 
 
 		 693 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  28.06 
 
 		 903 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  26.91 
 
 		 690 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  28.26 
 
 		 917 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 879 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  25.75 
 
 		 685 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.59 
 
 		 838 aa  134  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  26.29 
 
 		 720 aa  134  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  26.34 
 
 		 571 aa  133  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  29.04 
 
 		 885 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  28.87 
 
 		 966 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  27.65 
 
 		 972 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  28.5 
 
 		 979 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  29.09 
 
 		 888 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 		 877 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  26.29 
 
 		 705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10835  predicted protein  28.22 
 
 		 579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 688 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  26.29 
 
 		 705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  28.23 
 
 		 971 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  28.23 
 
 		 971 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  28.23 
 
 		 971 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  28.54 
 
 		 686 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  29.01 
 
 		 914 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  27.33 
 
 		 904 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 975 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 976 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  28.69 
 
 		 854 aa  131  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  28.23 
 
 		 964 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 975 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 975 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  27.53 
 
 		 686 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  27.53 
 
 		 686 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  28.05 
 
 		 965 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 975 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 975 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  25.54 
 
 		 656 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 975 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 975 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  28.03 
 
 		 972 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  27.53 
 
 		 686 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  27.53 
 
 		 686 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  28.92 
 
 		 969 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_002620  TC0371  translation initiation factor IF-2  26.87 
 
 		 896 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  27.93 
 
 		 964 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.99 
 
 		 903 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  28.03 
 
 		 971 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  27.84 
 
 		 871 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  28.24 
 
 		 986 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  25.46 
 
 		 692 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  26.37 
 
 		 601 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62149  predicted protein  25 
 
 		 625 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05630  GTPase, putative  24.8 
 
 		 877 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  26.75 
 
 		 871 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  27.18 
 
 		 964 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  27.84 
 
 		 854 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  26.88 
 
 		 686 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  26.88 
 
 		 686 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  27.23 
 
 		 882 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  27.47 
 
 		 688 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  28.07 
 
 		 999 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  28.32 
 
 		 951 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  27.53 
 
 		 689 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  28.32 
 
 		 946 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>