More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05630 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA05630  GTPase, putative  100 
 
 
877 aa  1781    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62149  predicted protein  42.2 
 
 
625 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  42.11 
 
 
981 aa  436  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  42.11 
 
 
975 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  42.48 
 
 
886 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
880 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
880 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  40.99 
 
 
904 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
880 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  40.34 
 
 
885 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  40.65 
 
 
856 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
880 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  41.24 
 
 
926 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  40.09 
 
 
920 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  41.17 
 
 
917 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  39.68 
 
 
848 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  41.71 
 
 
883 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  40.85 
 
 
917 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  40.99 
 
 
1053 aa  426  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  39.39 
 
 
848 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  40.79 
 
 
959 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  38.56 
 
 
832 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  40.38 
 
 
979 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  40.92 
 
 
880 aa  426  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  40.44 
 
 
882 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  40.79 
 
 
990 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  40.12 
 
 
880 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  40.6 
 
 
885 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  40.82 
 
 
964 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  41.38 
 
 
968 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  41.38 
 
 
853 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  40.38 
 
 
965 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  41.55 
 
 
890 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  40.29 
 
 
949 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  40.44 
 
 
889 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  39.46 
 
 
917 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  40.22 
 
 
875 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  40.98 
 
 
896 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
975 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  41.94 
 
 
924 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  41.98 
 
 
908 aa  419  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  39.81 
 
 
922 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
975 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  40.75 
 
 
972 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
975 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  40.6 
 
 
969 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  37.79 
 
 
873 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  40.22 
 
 
875 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  41.07 
 
 
975 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  38.97 
 
 
880 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  40.45 
 
 
970 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  39.88 
 
 
989 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  40.32 
 
 
887 aa  419  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  41.67 
 
 
908 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  38.65 
 
 
921 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  40.87 
 
 
948 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  40.51 
 
 
896 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  40.03 
 
 
894 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  40.44 
 
 
971 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  40.52 
 
 
732 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  40.47 
 
 
888 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  39.91 
 
 
972 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  40.6 
 
 
991 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  41.43 
 
 
739 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  40.91 
 
 
975 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  40.38 
 
 
966 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  40.47 
 
 
986 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  40.91 
 
 
975 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  40.16 
 
 
964 aa  416  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  41.11 
 
 
887 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  40.56 
 
 
949 aa  416  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  40.91 
 
 
975 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  40.74 
 
 
903 aa  416  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  40.62 
 
 
976 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  41.23 
 
 
1161 aa  416  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  44.42 
 
 
686 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  39.78 
 
 
884 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  38.87 
 
 
835 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  40.47 
 
 
971 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  39.97 
 
 
904 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  40 
 
 
964 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  39.78 
 
 
984 aa  416  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  40.28 
 
 
885 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  40.28 
 
 
885 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  39.66 
 
 
881 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  39.94 
 
 
971 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  39.97 
 
 
912 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  40.91 
 
 
848 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  40.47 
 
 
971 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  40.09 
 
 
868 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  41.35 
 
 
720 aa  412  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  39.81 
 
 
964 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  40.28 
 
 
989 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  40.75 
 
 
836 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  39.56 
 
 
897 aa  411  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  40.79 
 
 
822 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  40.13 
 
 
885 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  39.27 
 
 
971 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  40.75 
 
 
836 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  40.6 
 
 
838 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>