More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0371 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0371  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 896 aa  1836    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 		 970 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 822 aa  527  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  41.99 
 
 		 984 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  46.82 
 
 		 951 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  44.69 
 
 		 1079 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 892 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  46.09 
 
 		 732 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  46.82 
 
 		 946 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  43.3 
 
 		 907 aa  515  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 947 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  45.75 
 
 		 739 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  43.58 
 
 		 985 aa  512  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  42.29 
 
 		 868 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  42.29 
 
 		 868 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  39.5 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 		 924 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  42.98 
 
 		 997 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  45.61 
 
 		 984 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  44.16 
 
 		 943 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  43.91 
 
 		 883 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  45.77 
 
 		 943 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  45.94 
 
 		 992 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  45.94 
 
 		 948 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  46.64 
 
 		 950 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  45.77 
 
 		 943 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  39.4 
 
 		 882 aa  502  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  39.37 
 
 		 1058 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  44.8 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 		 880 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  44.63 
 
 		 876 aa  498  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  43.99 
 
 		 989 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  44.8 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  41.72 
 
 		 962 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 		 720 aa  495  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 		 975 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 		 975 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  43.52 
 
 		 898 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  44.97 
 
 		 953 aa  495  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 		 975 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  42.55 
 
 		 922 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 		 975 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  44.37 
 
 		 975 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  39.83 
 
 		 845 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  39.88 
 
 		 897 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  43.88 
 
 		 975 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  41.61 
 
 		 885 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  41.61 
 
 		 885 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  44.05 
 
 		 971 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  41.89 
 
 		 949 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  41.61 
 
 		 889 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  44.37 
 
 		 975 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  44.57 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  40.79 
 
 		 880 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  40.79 
 
 		 880 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  43.34 
 
 		 986 aa  492  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  41.3 
 
 		 885 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  43.55 
 
 		 980 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  43.56 
 
 		 976 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 968 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  43.72 
 
 		 986 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  42.78 
 
 		 945 aa  492  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  43.88 
 
 		 972 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  43.32 
 
 		 860 aa  492  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  44.18 
 
 		 882 aa  492  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  40.79 
 
 		 880 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  44.52 
 
 		 1079 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  43.84 
 
 		 921 aa  492  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  40.79 
 
 		 880 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  44.63 
 
 		 883 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  39.39 
 
 		 854 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  43.56 
 
 		 969 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  42.69 
 
 		 964 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  43.72 
 
 		 971 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  40.31 
 
 		 885 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  44.46 
 
 		 884 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  45.47 
 
 		 991 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  43.64 
 
 		 990 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  43.72 
 
 		 971 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  42.58 
 
 		 964 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  44.16 
 
 		 965 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  42.86 
 
 		 752 aa  489  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  43.83 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  43.57 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  40.86 
 
 		 829 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  39.97 
 
 		 834 aa  487  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  43.72 
 
 		 971 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  42.58 
 
 		 964 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  41.64 
 
 		 1029 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  42.66 
 
 		 896 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  43.31 
 
 		 686 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  43.74 
 
 		 688 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  40.54 
 
 		 848 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  44.77 
 
 		 971 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  39.73 
 
 		 884 aa  486  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  40.96 
 
 		 968 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>