More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0631 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
589 aa  1164    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  86.01 
 
 
592 aa  1031    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  58.93 
 
 
594 aa  692    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  88.68 
 
 
592 aa  1045    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  87.24 
 
 
588 aa  1052    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 
601 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 
597 aa  538  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  47.53 
 
 
578 aa  525  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  46.68 
 
 
600 aa  511  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  44.65 
 
 
602 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  45.1 
 
 
593 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  42.03 
 
 
593 aa  484  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  42.33 
 
 
598 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  42.42 
 
 
598 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  43.53 
 
 
598 aa  477  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  42.26 
 
 
598 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  43.71 
 
 
591 aa  472  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  43.2 
 
 
591 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 
598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  43.05 
 
 
589 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  41.39 
 
 
604 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  42.03 
 
 
591 aa  458  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  41.02 
 
 
593 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 
597 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  41.55 
 
 
599 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  41.89 
 
 
607 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  41.79 
 
 
604 aa  420  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  40.71 
 
 
602 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  36.13 
 
 
599 aa  362  9e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  36.21 
 
 
1228 aa  353  7e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.25 
 
 
623 aa  343  4e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  35.26 
 
 
1072 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  33.1 
 
 
997 aa  314  3.9999999999999997e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  29.26 
 
 
903 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  30.97 
 
 
888 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  31.42 
 
 
917 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.7 
 
 
970 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33386  mitochondrial translation initiation factor 2  30.73 
 
 
683 aa  150  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330812  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  27.65 
 
 
692 aa  150  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 
685 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.52 
 
 
903 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 
571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  28.22 
 
 
658 aa  148  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  28.24 
 
 
690 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  29.18 
 
 
946 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  29.18 
 
 
951 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  26.08 
 
 
656 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  27.9 
 
 
693 aa  146  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  29.83 
 
 
920 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  26.99 
 
 
887 aa  146  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  28.5 
 
 
905 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  26.54 
 
 
882 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 
876 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 
838 aa  143  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  28.34 
 
 
854 aa  142  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  26.26 
 
 
614 aa  141  3e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  29.03 
 
 
950 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  29.38 
 
 
822 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  28.38 
 
 
871 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  28.18 
 
 
885 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  28.67 
 
 
692 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 
877 aa  140  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  28.38 
 
 
854 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  30.09 
 
 
914 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  26.81 
 
 
689 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  28.03 
 
 
871 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  26.64 
 
 
686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  26.48 
 
 
686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  26.64 
 
 
686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  26.64 
 
 
686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  26.64 
 
 
686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  26.48 
 
 
686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  26.64 
 
 
688 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  28.67 
 
 
880 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  26.48 
 
 
997 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  27.46 
 
 
882 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  26.64 
 
 
686 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  29.41 
 
 
966 aa  137  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  28.84 
 
 
894 aa  137  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  28.15 
 
 
880 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  28.15 
 
 
880 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  28.15 
 
 
880 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  28.15 
 
 
845 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  28.15 
 
 
880 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  27.73 
 
 
922 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  27.36 
 
 
732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  29.02 
 
 
896 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  26.69 
 
 
673 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  27.78 
 
 
739 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  26.71 
 
 
908 aa  135  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  26.64 
 
 
688 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  27.99 
 
 
668 aa  135  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  27.1 
 
 
908 aa  135  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  29.43 
 
 
979 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  29.1 
 
 
965 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  28.5 
 
 
885 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  29.39 
 
 
896 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  27.81 
 
 
885 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  29.21 
 
 
848 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  27.81 
 
 
889 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>