More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0499 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
601 aa  1192    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 
588 aa  622  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
592 aa  615  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 
589 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 
592 aa  600  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
594 aa  591  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.202965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  50.08 
 
 
600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 
597 aa  565  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 
602 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  47.7 
 
 
578 aa  521  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  42.37 
 
 
593 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  43.43 
 
 
598 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 
598 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  44.25 
 
 
591 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  41.58 
 
 
598 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  42.83 
 
 
591 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  46.31 
 
 
589 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  41.25 
 
 
598 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  42.23 
 
 
598 aa  474  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  43.29 
 
 
604 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  41.64 
 
 
593 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  41.27 
 
 
593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  43.3 
 
 
599 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  42.16 
 
 
591 aa  445  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  40 
 
 
597 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  42.54 
 
 
604 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  41.92 
 
 
607 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  42.27 
 
 
602 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39.08 
 
 
1228 aa  403  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  39.53 
 
 
1072 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  38.18 
 
 
623 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  38.67 
 
 
599 aa  382  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  38.9 
 
 
997 aa  373  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  32.14 
 
 
658 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  28 
 
 
571 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  30.31 
 
 
693 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  29.97 
 
 
690 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  28.99 
 
 
903 aa  157  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  31.56 
 
 
854 aa  156  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  29.49 
 
 
614 aa  155  2e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  30.65 
 
 
692 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  30.81 
 
 
966 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  28.62 
 
 
673 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
888 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  30.07 
 
 
692 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  32.09 
 
 
904 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  29.97 
 
 
972 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  30.47 
 
 
965 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  29.83 
 
 
971 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  29.83 
 
 
971 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 
969 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  29.83 
 
 
971 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 
686 aa  150  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  30.3 
 
 
971 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 
686 aa  150  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 
686 aa  150  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 
686 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 
686 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  27.84 
 
 
689 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  30.3 
 
 
972 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  30.69 
 
 
964 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  27.65 
 
 
579 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 
688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  30.69 
 
 
964 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  28.25 
 
 
720 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  31.19 
 
 
979 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 
992 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 
992 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 
688 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  31.89 
 
 
880 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  29.97 
 
 
920 aa  147  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  27.76 
 
 
686 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
887 aa  147  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  27.76 
 
 
686 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 
976 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 
601 aa  147  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 
997 aa  146  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10835  predicted protein  29.83 
 
 
579 aa  146  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  30.85 
 
 
989 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  29.42 
 
 
815 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
975 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 
1101 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
975 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  30.75 
 
 
841 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
975 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  30.75 
 
 
837 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  29.9 
 
 
856 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
975 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.79 
 
 
903 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  28.23 
 
 
685 aa  145  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
975 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
975 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 
975 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  30.9 
 
 
949 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  30.75 
 
 
841 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  27.62 
 
 
905 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  29.5 
 
 
914 aa  145  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  27.45 
 
 
732 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 
846 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  27.02 
 
 
838 aa  144  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>