More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3384 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 591 aa  1191    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  53.72 
 
 		 599 aa  667    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  54.71 
 
 		 593 aa  692    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 591 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  53.63 
 
 		 604 aa  650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  68.02 
 
 		 591 aa  856    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  53.04 
 
 		 607 aa  652    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  57.92 
 
 		 602 aa  702    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  54.86 
 
 		 578 aa  634  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 593 aa  624  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 589 aa  621  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 597 aa  617  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 604 aa  590  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 602 aa  585  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 598 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 598 aa  561  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 598 aa  558  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 598 aa  537  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  46.64 
 
 		 600 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 597 aa  507  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  44.25 
 
 		 601 aa  486  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  45.32 
 
 		 594 aa  482  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  43.49 
 
 		 592 aa  481  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  43.29 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  43.71 
 
 		 589 aa  472  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  43.17 
 
 		 593 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  36.73 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39.92 
 
 		 1228 aa  362  9e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.16 
 
 		 1072 aa  359  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  37.29 
 
 		 997 aa  352  1e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  34.27 
 
 		 599 aa  329  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  31.51 
 
 		 887 aa  188  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  31.63 
 
 		 1042 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  33.12 
 
 		 882 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.8 
 
 		 903 aa  183  9.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  31.45 
 
 		 1113 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  32.42 
 
 		 711 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  29.84 
 
 		 908 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  31.3 
 
 		 692 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  32.54 
 
 		 879 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  31.67 
 
 		 658 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 921 aa  181  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  30.94 
 
 		 854 aa  180  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  32.5 
 
 		 886 aa  180  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  32.02 
 
 		 885 aa  179  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  29.64 
 
 		 908 aa  179  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  31.13 
 
 		 880 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.37 
 
 		 656 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  32.95 
 
 		 992 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 		 1124 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  33.91 
 
 		 843 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  32.54 
 
 		 689 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  31.36 
 
 		 924 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  30.65 
 
 		 903 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 		 1104 aa  177  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  30.84 
 
 		 897 aa  177  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  30.67 
 
 		 965 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  30.87 
 
 		 693 aa  176  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  30.31 
 
 		 614 aa  176  9e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.4 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  31.56 
 
 		 928 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  30.7 
 
 		 871 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  30.23 
 
 		 1030 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  31.38 
 
 		 876 aa  174  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  30.51 
 
 		 690 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  29.01 
 
 		 949 aa  173  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  30.37 
 
 		 984 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  29.57 
 
 		 971 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  30.94 
 
 		 904 aa  173  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 972 aa  173  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  31.07 
 
 		 1183 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  30.05 
 
 		 905 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  31.37 
 
 		 1045 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  32.32 
 
 		 835 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  32.13 
 
 		 856 aa  173  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  31.19 
 
 		 995 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  32.61 
 
 		 848 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  30.95 
 
 		 854 aa  173  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  30.23 
 
 		 1176 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  30.33 
 
 		 920 aa  172  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  30.18 
 
 		 989 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  30.97 
 
 		 979 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  29.41 
 
 		 877 aa  172  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  30.18 
 
 		 989 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 971 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 975 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  31.16 
 
 		 992 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 975 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 		 976 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 975 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 975 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  31.16 
 
 		 992 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 972 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 969 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 		 871 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  31.38 
 
 		 999 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 		 871 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  31.13 
 
 		 989 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>