More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2489 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  53.63 
 
 
591 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  64.29 
 
 
589 aa  784    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
604 aa  1226    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  68.93 
 
 
591 aa  843    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  65.82 
 
 
593 aa  800    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  67.97 
 
 
593 aa  827    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 
602 aa  645    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 
591 aa  619  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  52.47 
 
 
578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  48.84 
 
 
599 aa  598  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  48.83 
 
 
607 aa  587  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 
597 aa  579  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  48.99 
 
 
604 aa  566  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 
602 aa  546  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  47 
 
 
598 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 
598 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 
598 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 
598 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  47.83 
 
 
598 aa  523  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  42.62 
 
 
597 aa  485  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0331491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  43.12 
 
 
600 aa  476  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  43.17 
 
 
601 aa  474  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  42.23 
 
 
588 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  42.4 
 
 
592 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  41.39 
 
 
589 aa  463  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  43.05 
 
 
593 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  41.4 
 
 
592 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  42.08 
 
 
594 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  37.05 
 
 
1228 aa  373  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.99 
 
 
623 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  36.07 
 
 
1072 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  34.56 
 
 
599 aa  332  9e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  35.22 
 
 
997 aa  329  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.55 
 
 
903 aa  186  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  31.06 
 
 
924 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  31.09 
 
 
1131 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  31.54 
 
 
692 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  31.24 
 
 
882 aa  177  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  31.12 
 
 
888 aa  176  8e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  31.09 
 
 
845 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  30.58 
 
 
1059 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  30.23 
 
 
854 aa  175  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  30.93 
 
 
705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  30.93 
 
 
705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  30.44 
 
 
720 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.51 
 
 
838 aa  171  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  29.66 
 
 
885 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  30.21 
 
 
689 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  31 
 
 
686 aa  171  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 
1104 aa  170  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  29.14 
 
 
1030 aa  170  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  31.34 
 
 
658 aa  169  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 
1042 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  30.53 
 
 
927 aa  169  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 
1101 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 
914 aa  169  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  28.92 
 
 
882 aa  168  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  29.22 
 
 
614 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  30.5 
 
 
905 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  30.65 
 
 
1176 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  29.84 
 
 
908 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
837 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 
679 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 
679 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  29.04 
 
 
739 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  30.99 
 
 
1045 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  30.23 
 
 
686 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  30.23 
 
 
686 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  29.88 
 
 
1183 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  30.23 
 
 
688 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  29.74 
 
 
732 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  31.06 
 
 
876 aa  166  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 
992 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  29.88 
 
 
1183 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  30.72 
 
 
908 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  31 
 
 
1124 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 
992 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 
686 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 
686 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 
686 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 
688 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  29.65 
 
 
1113 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  27.48 
 
 
877 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  29.47 
 
 
903 aa  164  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 
912 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 
970 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  29.43 
 
 
1038 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  30.78 
 
 
992 aa  163  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
921 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  30.43 
 
 
964 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  29.6 
 
 
904 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 
693 aa  162  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.82 
 
 
1128 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  29.32 
 
 
845 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  29.67 
 
 
911 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 
887 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  28.77 
 
 
1161 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 
571 aa  161  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>