More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0628 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  88.68 
 
 		 589 aa  1045    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 		 594 aa  675    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 592 aa  1171    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  87.01 
 
 		 588 aa  1044    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  87.39 
 
 		 592 aa  1047    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 601 aa  615  1e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  47.62 
 
 		 578 aa  525  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  46.44 
 
 		 597 aa  523  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  46.42 
 
 		 600 aa  515  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  44.99 
 
 		 602 aa  496  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 598 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 591 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  42.4 
 
 		 598 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  41.81 
 
 		 593 aa  472  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  42.4 
 
 		 598 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  42.91 
 
 		 598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  41.94 
 
 		 591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 		 598 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 		 593 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  41.4 
 
 		 604 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  42.13 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 589 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  40.61 
 
 		 597 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  40.2 
 
 		 593 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  40.64 
 
 		 599 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  40.81 
 
 		 604 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  39.76 
 
 		 607 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  40.57 
 
 		 602 aa  399  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.47 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.69 
 
 		 623 aa  346  8e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  35.19 
 
 		 1228 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  34.69 
 
 		 1072 aa  341  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  35.19 
 
 		 997 aa  314  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 571 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  29.19 
 
 		 903 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 658 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  30 
 
 		 917 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.73 
 
 		 970 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  28.15 
 
 		 692 aa  147  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33386  mitochondrial translation initiation factor 2  32.18 
 
 		 683 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 888 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  26.79 
 
 		 614 aa  144  3e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 688 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  27.74 
 
 		 688 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  27.57 
 
 		 686 aa  144  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  27.57 
 
 		 686 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  26.83 
 
 		 887 aa  143  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  28.64 
 
 		 946 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  27.74 
 
 		 686 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  27.91 
 
 		 690 aa  143  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  27.57 
 
 		 686 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  27.57 
 
 		 686 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  28.64 
 
 		 951 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  26.98 
 
 		 686 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  27.5 
 
 		 689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  26.98 
 
 		 686 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  28.62 
 
 		 685 aa  142  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  28.38 
 
 		 739 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  27.94 
 
 		 903 aa  140  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  27.62 
 
 		 693 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  28.96 
 
 		 920 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  27.89 
 
 		 905 aa  139  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  27.77 
 
 		 732 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  30.32 
 
 		 822 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  26.54 
 
 		 997 aa  138  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  27.84 
 
 		 838 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  27.85 
 
 		 579 aa  137  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  27.18 
 
 		 882 aa  136  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  28.42 
 
 		 950 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  30.75 
 
 		 843 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  28.15 
 
 		 673 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  28.62 
 
 		 876 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  26.53 
 
 		 908 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  28.48 
 
 		 692 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  26.66 
 
 		 908 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  29.55 
 
 		 879 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  27.97 
 
 		 854 aa  134  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  27.36 
 
 		 880 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  28.21 
 
 		 1042 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  25.08 
 
 		 656 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 966 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  27.27 
 
 		 668 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  27.23 
 
 		 912 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 		 984 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  28.64 
 
 		 815 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  29.83 
 
 		 964 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  29.39 
 
 		 965 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  28.84 
 
 		 949 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  28.08 
 
 		 877 aa  131  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  29.46 
 
 		 964 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  26.91 
 
 		 887 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 		 601 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  28.72 
 
 		 992 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  28.69 
 
 		 894 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  28.72 
 
 		 992 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  31.42 
 
 		 968 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  26.54 
 
 		 882 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  27.71 
 
 		 883 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  28.25 
 
 		 883 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  27.27 
 
 		 882 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>