More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1473 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  78.47 
 
 
571 aa  881    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
579 aa  1160    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  55.45 
 
 
601 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  45.88 
 
 
903 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  45.25 
 
 
732 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  46.6 
 
 
985 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.1 
 
 
692 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 
739 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  45.38 
 
 
1161 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  45.44 
 
 
969 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 
668 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  45.09 
 
 
975 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  45.09 
 
 
975 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  45.03 
 
 
972 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  45.09 
 
 
975 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  44.31 
 
 
689 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 
686 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  44.16 
 
 
964 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 
686 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 
686 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 
686 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 
975 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 
975 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 
975 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 
971 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 
976 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  49.21 
 
 
854 aa  485  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 
686 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  48.32 
 
 
979 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 
975 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 
971 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  45.12 
 
 
1029 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  44.83 
 
 
971 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 
971 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  44.83 
 
 
972 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 
686 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  43.92 
 
 
688 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 
686 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 
679 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 
679 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 
882 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 
686 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  45.63 
 
 
822 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  44.19 
 
 
997 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  44.69 
 
 
968 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  43.48 
 
 
688 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  44.16 
 
 
673 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  43.87 
 
 
868 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  43.87 
 
 
868 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 
964 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  48.22 
 
 
986 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 
989 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  44.14 
 
 
877 aa  477  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.06 
 
 
1079 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  44.73 
 
 
970 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  43.65 
 
 
984 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  44.8 
 
 
964 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 
953 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  44.99 
 
 
971 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  43.79 
 
 
904 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 
966 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 
946 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  43.99 
 
 
965 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  44.85 
 
 
888 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 
951 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  46.6 
 
 
1131 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  43.85 
 
 
892 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  43.79 
 
 
838 aa  473  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 
883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 
860 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 
720 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  43.61 
 
 
980 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 
885 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  43.88 
 
 
986 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  43.77 
 
 
1058 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  43.97 
 
 
922 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  43.08 
 
 
884 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  44.39 
 
 
984 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  43.61 
 
 
882 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 
854 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 
888 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  42.98 
 
 
907 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  44.66 
 
 
1005 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  44.89 
 
 
1079 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 
889 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  46.85 
 
 
943 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  47.41 
 
 
990 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  43.74 
 
 
882 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  43.75 
 
 
868 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 
871 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 
845 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  44.08 
 
 
991 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 
711 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  43.3 
 
 
898 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  43.18 
 
 
689 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  46.32 
 
 
945 aa  467  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 
885 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 
885 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  44.21 
 
 
880 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 
882 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>