More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0229 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 593 aa  1209    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  42.37 
 
 		 601 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  45.25 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  44.26 
 
 		 602 aa  497  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  42.03 
 
 		 589 aa  484  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  41.65 
 
 		 597 aa  480  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  42.01 
 
 		 592 aa  477  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  41.26 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  43.94 
 
 		 598 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  43.43 
 
 		 598 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  43.51 
 
 		 598 aa  475  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  41.81 
 
 		 592 aa  472  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  43.6 
 
 		 591 aa  475  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  42.23 
 
 		 600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  43.17 
 
 		 591 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  41.64 
 
 		 591 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  43.6 
 
 		 598 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 598 aa  465  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 		 593 aa  465  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  43.7 
 
 		 589 aa  464  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  43.05 
 
 		 604 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  39.73 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  41.32 
 
 		 593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  40.07 
 
 		 597 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  40.31 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  39.06 
 
 		 607 aa  442  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  40.57 
 
 		 604 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  38.89 
 
 		 602 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  38.1 
 
 		 1228 aa  342  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  35.8 
 
 		 1072 aa  336  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  37.52 
 
 		 623 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  36.53 
 
 		 997 aa  312  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  33.73 
 
 		 599 aa  301  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  28.85 
 
 		 838 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  30.45 
 
 		 658 aa  156  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  30.98 
 
 		 888 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 693 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  28.96 
 
 		 905 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  29.06 
 
 		 908 aa  154  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 		 908 aa  154  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 690 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  29.49 
 
 		 685 aa  153  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  28.21 
 
 		 903 aa  152  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  29.21 
 
 		 885 aa  151  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.64 
 
 		 601 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  29.19 
 
 		 854 aa  150  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  30.28 
 
 		 829 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  27.84 
 
 		 848 aa  148  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  27.38 
 
 		 882 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  30.32 
 
 		 692 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  28.84 
 
 		 868 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  28.82 
 
 		 896 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  29.33 
 
 		 885 aa  146  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  27.82 
 
 		 885 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  27.57 
 
 		 997 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  29.5 
 
 		 957 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  30.37 
 
 		 873 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  29.05 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  29.89 
 
 		 949 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  27.69 
 
 		 889 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  27.68 
 
 		 1059 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 880 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 880 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  29.39 
 
 		 882 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 880 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  27.65 
 
 		 889 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 880 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  29.3 
 
 		 895 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  28.82 
 
 		 966 aa  144  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  28.35 
 
 		 1044 aa  144  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  28.78 
 
 		 992 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  27.47 
 
 		 885 aa  143  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  27.47 
 
 		 885 aa  143  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  28.78 
 
 		 992 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  29.71 
 
 		 887 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  30.54 
 
 		 998 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  27.89 
 
 		 880 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  29.12 
 
 		 668 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 656 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  28.31 
 
 		 896 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 		 894 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  29.3 
 
 		 939 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29 
 
 		 970 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  28.08 
 
 		 904 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  28.78 
 
 		 885 aa  141  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  27.18 
 
 		 884 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2814  translation initiation factor IF-2  28.54 
 
 		 845 aa  141  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572575  hitchhiker  0.00404831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  29.31 
 
 		 836 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  27.8 
 
 		 972 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  29.31 
 
 		 836 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  28.42 
 
 		 979 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  29.72 
 
 		 897 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 946 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  27.33 
 
 		 1030 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  29.16 
 
 		 951 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  29.31 
 
 		 838 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  27.39 
 
 		 692 aa  140  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  28.66 
 
 		 1079 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  27.15 
 
 		 908 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  28.49 
 
 		 992 aa  140  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>