More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2814 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2814  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
845 aa  1679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572575  hitchhiker  0.00404831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  48.82 
 
 
970 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.66 
 
 
980 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  47.05 
 
 
947 aa  542  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  48.58 
 
 
903 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.66 
 
 
986 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  48.49 
 
 
985 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 
883 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  46 
 
 
884 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.71 
 
 
888 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 
882 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.7 
 
 
882 aa  529  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  47.69 
 
 
854 aa  528  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 
946 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 
951 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 
1079 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 
845 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0956  translation initiation factor IF-2  45.32 
 
 
683 aa  521  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  46.22 
 
 
692 aa  519  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  46.08 
 
 
689 aa  522  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  45 
 
 
921 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  46.28 
 
 
822 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  48.14 
 
 
950 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  45.5 
 
 
962 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  45.96 
 
 
1005 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  44.34 
 
 
892 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  44.05 
 
 
686 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  46.15 
 
 
1029 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 
997 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  44.37 
 
 
880 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  45.48 
 
 
1030 aa  505  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  44.89 
 
 
1161 aa  505  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  44.76 
 
 
880 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  43.38 
 
 
880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  45.19 
 
 
896 aa  500  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  44.59 
 
 
885 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  43.38 
 
 
880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  43.38 
 
 
880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  45.27 
 
 
984 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  44.63 
 
 
971 aa  502  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  45.64 
 
 
898 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  42.48 
 
 
1011 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  44.59 
 
 
885 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  44.59 
 
 
885 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  43.38 
 
 
880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  44.59 
 
 
889 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  44.52 
 
 
774 aa  498  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  44.73 
 
 
732 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  45.45 
 
 
949 aa  499  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  43.74 
 
 
739 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  43.09 
 
 
593 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  44.73 
 
 
658 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  43.44 
 
 
1183 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 
705 aa  495  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  43.62 
 
 
593 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  41.1 
 
 
873 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  44.26 
 
 
894 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  43.77 
 
 
884 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  46.37 
 
 
1079 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  44.8 
 
 
689 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  45.42 
 
 
964 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 
891 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 
705 aa  495  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  43.75 
 
 
882 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 
848 aa  494  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  44.12 
 
 
686 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  44.12 
 
 
686 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  43.63 
 
 
896 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  45.16 
 
 
1038 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  42.95 
 
 
894 aa  492  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 
860 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 
917 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  38.7 
 
 
879 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  44.13 
 
 
848 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 
887 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  45.72 
 
 
868 aa  489  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  43.28 
 
 
896 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  44.12 
 
 
686 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  43.97 
 
 
1042 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  43.95 
 
 
686 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  44.12 
 
 
686 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  44.12 
 
 
686 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 
1131 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  44.43 
 
 
902 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  43.42 
 
 
885 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  43.95 
 
 
686 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  48.51 
 
 
874 aa  488  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  43.78 
 
 
593 aa  489  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  43.69 
 
 
907 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 
992 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 
992 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  43.75 
 
 
885 aa  487  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  48.73 
 
 
917 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 
1183 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  45.47 
 
 
940 aa  488  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  43.58 
 
 
881 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  43.62 
 
 
949 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  43.95 
 
 
688 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  42.83 
 
 
992 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  43.67 
 
 
752 aa  484  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>