More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1236 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 601 aa  1209    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  56.05 
 
 		 571 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  55.45 
 
 		 579 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 692 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.79 
 
 		 903 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  45.03 
 
 		 732 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 882 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.31 
 
 		 898 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  44.46 
 
 		 739 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  46.04 
 
 		 894 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 868 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  45.15 
 
 		 868 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  50.8 
 
 		 896 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 885 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 		 880 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  51.5 
 
 		 869 aa  505  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 881 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 853 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 885 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 		 868 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  44.82 
 
 		 897 aa  502  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.89 
 
 		 884 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.1 
 
 		 979 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 880 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  45.81 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 885 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 885 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  51.32 
 
 		 928 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 889 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 882 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  44.65 
 
 		 895 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 		 997 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  46.04 
 
 		 902 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 894 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 896 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  47.22 
 
 		 945 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 		 883 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 		 868 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 		 668 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  50.1 
 
 		 891 aa  495  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.1 
 
 		 884 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  48.41 
 
 		 943 aa  494  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 		 1079 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 892 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 720 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 964 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  49.21 
 
 		 854 aa  491  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 686 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  43.46 
 
 		 907 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  49.51 
 
 		 930 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 		 689 aa  492  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  44.82 
 
 		 883 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 964 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 838 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 930 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  46.22 
 
 		 822 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 964 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  49.02 
 
 		 986 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  48.33 
 
 		 882 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  47.6 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  47.6 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  50.3 
 
 		 966 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  43.83 
 
 		 968 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 975 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  49.2 
 
 		 875 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 975 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 		 877 aa  486  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  43.71 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.1 
 
 		 985 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  48.9 
 
 		 971 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  49.2 
 
 		 875 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 971 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 971 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  50.1 
 
 		 934 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 831 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  47.6 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 971 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 975 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 971 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  44.17 
 
 		 972 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  43.33 
 
 		 984 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.02 
 
 		 921 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  48.83 
 
 		 980 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  49.22 
 
 		 845 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 922 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 688 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 975 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 976 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 975 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 880 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  51.31 
 
 		 901 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 975 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>