More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1296 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
598 aa  1204    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  86.29 
 
 
598 aa  1073    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  73.08 
 
 
598 aa  915    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  86.29 
 
 
598 aa  1074    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  85.95 
 
 
598 aa  1072    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 
602 aa  553  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
591 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 
591 aa  551  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  45.56 
 
 
597 aa  533  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  47.83 
 
 
604 aa  534  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  47.91 
 
 
578 aa  533  1e-150  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  45.09 
 
 
593 aa  521  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  47.99 
 
 
589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  44.57 
 
 
599 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 
593 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 
591 aa  511  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  44.24 
 
 
607 aa  504  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  43.43 
 
 
601 aa  496  1e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  44.74 
 
 
604 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  44.26 
 
 
592 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  41.92 
 
 
588 aa  480  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 
602 aa  479  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 
592 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 
589 aa  481  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  44.48 
 
 
597 aa  475  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 
593 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 
594 aa  457  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.202965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  42.78 
 
 
600 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  35.36 
 
 
1228 aa  343  5.999999999999999e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  34.38 
 
 
623 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  36.74 
 
 
1072 aa  340  5.9999999999999996e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  34.18 
 
 
599 aa  327  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  35.31 
 
 
997 aa  320  7e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  32.02 
 
 
686 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  32.02 
 
 
686 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  32.02 
 
 
686 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  32.02 
 
 
686 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  31.26 
 
 
686 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  31.26 
 
 
686 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  32.02 
 
 
686 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  31.38 
 
 
689 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  31.64 
 
 
688 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  31.62 
 
 
688 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  31.68 
 
 
693 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  31.5 
 
 
690 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  33.55 
 
 
711 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  33.77 
 
 
658 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  31.75 
 
 
732 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  30.85 
 
 
705 aa  187  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  30.85 
 
 
705 aa  187  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  32.22 
 
 
692 aa  186  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  30.77 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  31.45 
 
 
838 aa  184  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  32.13 
 
 
720 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  32.48 
 
 
985 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  32.11 
 
 
882 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  29.14 
 
 
951 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  29.14 
 
 
946 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.81 
 
 
903 aa  181  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  31.42 
 
 
679 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  31.42 
 
 
679 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  30.95 
 
 
739 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  28.62 
 
 
950 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  31.61 
 
 
822 aa  179  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  30.46 
 
 
877 aa  178  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.43 
 
 
970 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  29.11 
 
 
992 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  29.11 
 
 
992 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  31.88 
 
 
1029 aa  177  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  29.41 
 
 
1030 aa  176  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  31.53 
 
 
686 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  29.78 
 
 
1042 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 
885 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  32.92 
 
 
1131 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  30.99 
 
 
692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  31.52 
 
 
1005 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  30.53 
 
 
949 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 
1104 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  32.98 
 
 
854 aa  174  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  31.21 
 
 
903 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 
879 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  34.26 
 
 
997 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  33.69 
 
 
685 aa  174  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.57 
 
 
601 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  29.7 
 
 
1183 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  32.76 
 
 
914 aa  173  9e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  30.27 
 
 
908 aa  172  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  29.16 
 
 
1176 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 
1128 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  30 
 
 
885 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  32.72 
 
 
928 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  32.14 
 
 
971 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  28.38 
 
 
571 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  31.31 
 
 
845 aa  171  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  29.74 
 
 
1113 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  30.31 
 
 
897 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  32.2 
 
 
874 aa  171  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  32.64 
 
 
829 aa  171  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  30.37 
 
 
854 aa  170  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  30.37 
 
 
871 aa  170  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>