More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1389 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  74.75 
 
 		 598 aa  954    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 598 aa  1204    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  95.65 
 
 		 598 aa  1167    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  86.29 
 
 		 598 aa  1054    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  97.32 
 
 		 598 aa  1181    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  48.07 
 
 		 602 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 591 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  48.5 
 
 		 578 aa  541  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 604 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  45.5 
 
 		 593 aa  532  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  45.58 
 
 		 593 aa  529  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  45.24 
 
 		 599 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 		 591 aa  519  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  46.74 
 
 		 604 aa  518  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  46.24 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  46.58 
 
 		 589 aa  513  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  45.74 
 
 		 602 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  43.41 
 
 		 592 aa  491  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  41.58 
 
 		 601 aa  484  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 		 588 aa  482  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  42.4 
 
 		 592 aa  480  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  42.33 
 
 		 589 aa  480  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  43.94 
 
 		 593 aa  477  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 597 aa  476  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  42.54 
 
 		 594 aa  466  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  42.95 
 
 		 600 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.54 
 
 		 623 aa  344  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.69 
 
 		 1072 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.24 
 
 		 599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  34.52 
 
 		 1228 aa  336  7e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  36.88 
 
 		 997 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  33.76 
 
 		 720 aa  194  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 686 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 686 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 686 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 686 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 686 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  31.55 
 
 		 686 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  31.79 
 
 		 705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  31.55 
 
 		 686 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  31.79 
 
 		 705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 688 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  32.34 
 
 		 688 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  32.68 
 
 		 732 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  31.27 
 
 		 689 aa  190  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  33.47 
 
 		 693 aa  189  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  34.2 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  33.47 
 
 		 690 aa  189  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  31.41 
 
 		 692 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 951 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 946 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  32.09 
 
 		 739 aa  184  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  29.11 
 
 		 992 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  29.11 
 
 		 992 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 970 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  32.41 
 
 		 679 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  32.41 
 
 		 679 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 950 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.72 
 
 		 601 aa  179  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  28.65 
 
 		 1104 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  30.62 
 
 		 949 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  29.53 
 
 		 1042 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  33.12 
 
 		 711 aa  178  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  31.94 
 
 		 686 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  29.26 
 
 		 1030 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  32.97 
 
 		 882 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  30.58 
 
 		 822 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  30.59 
 
 		 885 aa  177  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  31.47 
 
 		 838 aa  177  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  31.02 
 
 		 897 aa  176  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.57 
 
 		 571 aa  177  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  32.44 
 
 		 964 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  28.47 
 
 		 1059 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  32.71 
 
 		 829 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  32.77 
 
 		 985 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  30.24 
 
 		 673 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  32.8 
 
 		 928 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  33.47 
 
 		 845 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  31.74 
 
 		 903 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  31.88 
 
 		 1131 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 		 879 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  28.83 
 
 		 1128 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  28.67 
 
 		 1124 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  28.65 
 
 		 1183 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  31.66 
 
 		 992 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  28.83 
 
 		 1176 aa  174  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  32.52 
 
 		 685 aa  173  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  29.7 
 
 		 1005 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  28.42 
 
 		 1113 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  31.62 
 
 		 845 aa  173  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  29.91 
 
 		 904 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  31.95 
 
 		 964 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.36 
 
 		 903 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  28.14 
 
 		 1126 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 1114 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  31.95 
 
 		 964 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 		 1161 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 		 1183 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>