More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01090 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  62.2 
 
 		 1072 aa  809    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  59.23 
 
 		 997 aa  742    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  53.41 
 
 		 623 aa  657    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  100 
 
 		 1228 aa  2443    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  50.66 
 
 		 599 aa  593  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  39.08 
 
 		 601 aa  398  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  38.97 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  38.58 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  37.29 
 
 		 604 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  40.68 
 
 		 599 aa  365  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  39.09 
 
 		 593 aa  364  6e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  39.77 
 
 		 591 aa  362  4e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  40.24 
 
 		 589 aa  361  5e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  35.36 
 
 		 591 aa  358  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  40.04 
 
 		 591 aa  358  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  36.11 
 
 		 593 aa  357  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  38.72 
 
 		 602 aa  353  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  36.95 
 
 		 600 aa  350  8e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  38.6 
 
 		 589 aa  349  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  39.53 
 
 		 607 aa  346  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  39.2 
 
 		 597 aa  345  4e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  40 
 
 		 578 aa  345  4e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  38.21 
 
 		 588 aa  344  5e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  35.19 
 
 		 592 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  38.1 
 
 		 593 aa  337  5.999999999999999e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  36.36 
 
 		 598 aa  336  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  35.57 
 
 		 592 aa  336  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  36.1 
 
 		 598 aa  334  5e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  37.18 
 
 		 598 aa  330  7e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  34.92 
 
 		 598 aa  330  9e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  39.24 
 
 		 604 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  35.2 
 
 		 598 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  39.03 
 
 		 602 aa  327  7e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  28.78 
 
 		 882 aa  168  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 905 aa  165  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.67 
 
 		 903 aa  164  9e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  28.63 
 
 		 985 aa  161  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  28.39 
 
 		 908 aa  161  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 908 aa  160  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.21 
 
 		 903 aa  159  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  27.21 
 
 		 885 aa  158  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  28.2 
 
 		 874 aa  157  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  28.44 
 
 		 921 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 		 887 aa  155  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  29.81 
 
 		 690 aa  154  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  28.96 
 
 		 686 aa  154  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 914 aa  154  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  28.74 
 
 		 962 aa  154  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 693 aa  153  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  28.63 
 
 		 838 aa  152  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  28.49 
 
 		 917 aa  152  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  28.33 
 
 		 1059 aa  152  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  29.52 
 
 		 689 aa  151  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  27.87 
 
 		 882 aa  151  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  28.46 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  27.74 
 
 		 700 aa  150  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 1104 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  28.36 
 
 		 897 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  28.49 
 
 		 1183 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 1176 aa  150  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  28.91 
 
 		 888 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 1113 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  27.61 
 
 		 997 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  28.3 
 
 		 970 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  28.44 
 
 		 1011 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  29.35 
 
 		 1101 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  26.92 
 
 		 1079 aa  149  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  29.19 
 
 		 877 aa  149  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  26.68 
 
 		 896 aa  148  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 		 679 aa  148  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  28.51 
 
 		 860 aa  147  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  29.63 
 
 		 679 aa  147  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  28.94 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  29.65 
 
 		 854 aa  147  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  27.02 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  30.75 
 
 		 692 aa  147  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 		 1183 aa  147  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  30.92 
 
 		 871 aa  146  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  29.5 
 
 		 822 aa  146  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  29.6 
 
 		 992 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  28.54 
 
 		 995 aa  147  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  29.6 
 
 		 992 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  29.41 
 
 		 999 aa  147  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  27.68 
 
 		 888 aa  145  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  28.76 
 
 		 1030 aa  146  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 976 aa  145  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 		 774 aa  146  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  30.92 
 
 		 854 aa  145  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  30.7 
 
 		 871 aa  145  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  27.82 
 
 		 1005 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  35.79 
 
 		 656 aa  145  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  28.51 
 
 		 1029 aa  145  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  28.39 
 
 		 896 aa  145  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  27.38 
 
 		 854 aa  144  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  27.48 
 
 		 990 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  28.19 
 
 		 959 aa  144  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  27.69 
 
 		 971 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  28.82 
 
 		 843 aa  144  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  28.18 
 
 		 1124 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  27.81 
 
 		 990 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>