More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0667 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0667  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
826 aa  1656    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 
986 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 
980 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 
882 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  44.97 
 
 
884 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.14 
 
 
692 aa  598  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 
1161 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  47.63 
 
 
985 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 
883 aa  592  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 
1029 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 
945 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  46.08 
 
 
903 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 
739 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 
732 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 
921 aa  582  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
997 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 
686 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 
822 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50.35 
 
 
971 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  48.22 
 
 
947 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  52.26 
 
 
1035 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  48.49 
 
 
860 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  46.01 
 
 
984 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 
924 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  44.67 
 
 
943 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
940 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.05 
 
 
888 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 
689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
845 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 
949 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  44.69 
 
 
720 aa  560  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  46.47 
 
 
1005 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 
1079 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  47.49 
 
 
882 aa  556  1e-157  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 
686 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 
686 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 
686 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 
686 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  50.97 
 
 
1022 aa  557  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 
686 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 
686 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 
853 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 
686 aa  557  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
679 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
679 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  44.14 
 
 
882 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  48.96 
 
 
688 aa  555  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  50.18 
 
 
952 aa  554  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 
962 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  46.82 
 
 
892 aa  555  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  47.58 
 
 
979 aa  551  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 
922 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 
915 aa  550  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 
1030 aa  549  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 
920 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  47.52 
 
 
688 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 
884 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  42.36 
 
 
873 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  42.63 
 
 
1011 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 
705 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 
986 aa  543  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 
705 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.86 
 
 
907 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  42.09 
 
 
956 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
856 aa  545  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 
1008 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
1079 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  44.08 
 
 
882 aa  545  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 
992 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 
991 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 
975 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 
975 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 
975 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 
975 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  43.97 
 
 
885 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 
976 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 
975 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 
975 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 
975 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  48.53 
 
 
898 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  48.37 
 
 
984 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  46.04 
 
 
949 aa  542  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  47.84 
 
 
936 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 
896 aa  538  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  46.7 
 
 
875 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  47.85 
 
 
1083 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 
971 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  46.7 
 
 
875 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 
992 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  46.92 
 
 
1128 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  46.22 
 
 
891 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 
992 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  47.36 
 
 
1113 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
969 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  47.19 
 
 
1042 aa  538  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  48.79 
 
 
971 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  48.46 
 
 
943 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 
971 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 
848 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.13 
 
 
752 aa  537  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>