More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0522 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0522  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 779 aa  1588    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  46.48 
 
 		 887 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  45.14 
 
 		 822 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 		 880 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  45.64 
 
 		 856 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  43.73 
 
 		 921 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  44.66 
 
 		 990 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  44.66 
 
 		 964 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  45.69 
 
 		 885 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  44.66 
 
 		 959 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  43.95 
 
 		 886 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  44.13 
 
 		 868 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  44.04 
 
 		 871 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  45.01 
 
 		 926 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  45.95 
 
 		 903 aa  475  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 917 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  43.71 
 
 		 883 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 883 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  41.08 
 
 		 861 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  42.96 
 
 		 917 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  41.13 
 
 		 832 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  49.2 
 
 		 692 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  43.41 
 
 		 1161 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  44.72 
 
 		 860 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  44.97 
 
 		 924 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  42.53 
 
 		 848 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  43.03 
 
 		 873 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  42.63 
 
 		 1083 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 838 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  40.85 
 
 		 875 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  43.51 
 
 		 1045 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 836 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  46.18 
 
 		 947 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  44.12 
 
 		 884 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  40.85 
 
 		 875 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 836 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  42.73 
 
 		 981 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  41.86 
 
 		 949 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  41.29 
 
 		 1029 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  44.46 
 
 		 883 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  43.74 
 
 		 971 aa  459  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  42.91 
 
 		 975 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  43.68 
 
 		 886 aa  458  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  43.06 
 
 		 848 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  42.18 
 
 		 835 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 		 898 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  42.68 
 
 		 990 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  43.31 
 
 		 945 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  40.39 
 
 		 986 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  42.68 
 
 		 989 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  42.59 
 
 		 955 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  42.68 
 
 		 989 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  40.7 
 
 		 892 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  40.03 
 
 		 907 aa  452  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  43.31 
 
 		 985 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  42.63 
 
 		 902 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  42.18 
 
 		 887 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  42.78 
 
 		 739 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  42.68 
 
 		 968 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0467  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 		 848 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.323718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  42.71 
 
 		 915 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  44.53 
 
 		 1022 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0563  translation initiation factor IF-2  41.81 
 
 		 830 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.114537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  43.16 
 
 		 732 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  44.55 
 
 		 962 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  40.89 
 
 		 882 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  42.43 
 
 		 936 aa  446  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  43.43 
 
 		 986 aa  445  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  42.11 
 
 		 894 aa  446  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  43.53 
 
 		 904 aa  445  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  41.86 
 
 		 922 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  43.8 
 
 		 952 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  41.33 
 
 		 1051 aa  446  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  40.09 
 
 		 980 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  38 
 
 		 881 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  44 
 
 		 971 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  42.42 
 
 		 930 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  43.69 
 
 		 752 aa  442  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  41.55 
 
 		 879 aa  446  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  42.78 
 
 		 971 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  42.55 
 
 		 951 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  42.73 
 
 		 908 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  42.73 
 
 		 876 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  42.18 
 
 		 824 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  44 
 
 		 972 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  43.31 
 
 		 845 aa  442  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  43.03 
 
 		 689 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  43.91 
 
 		 920 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  43.13 
 
 		 885 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  43.13 
 
 		 885 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  43.13 
 
 		 889 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  44.26 
 
 		 921 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  42.66 
 
 		 888 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  43.82 
 
 		 975 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  43.82 
 
 		 975 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  43.64 
 
 		 976 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  42.15 
 
 		 884 aa  439  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  42.43 
 
 		 880 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 		 991 aa  439  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  42.43 
 
 		 882 aa  439  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>