More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2658 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  81.11 
 
 		 226 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  81.11 
 
 		 226 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  81.57 
 
 		 226 aa  329  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  72.77 
 
 		 228 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  75.46 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  66.22 
 
 		 236 aa  299  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  65.45 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  63.93 
 
 		 230 aa  280  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  65.62 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  65.62 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  65.74 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  63.77 
 
 		 231 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  64.22 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  64.22 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  64.22 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  58.37 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  58.56 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  59.81 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  54.34 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  55.09 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  57.01 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  54.71 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  56.73 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  54.72 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  60.98 
 
 		 229 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  51.79 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  53.6 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  50.92 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  50.92 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  52.45 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  45.42 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  53.23 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  50 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  49.56 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  53.15 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  53.15 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  49.78 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  48.53 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  52.22 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  50.9 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  52.17 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  48.44 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  51.69 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  50.23 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  46.6 
 
 		 389 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  46.89 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  40.81 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  35.4 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.25 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 258 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.8 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.8 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.8 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.8 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  36.89 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.91 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.94 
 
 		 244 aa  111  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.91 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.36 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  36.28 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.8 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.24 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  35 
 
 		 256 aa  95.5  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.48 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 274 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  30.04 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.22 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  35.71 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.5 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>