More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08060 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  65.65 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  60.67 
 
 
335 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  59.45 
 
 
334 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  59.88 
 
 
336 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  58.05 
 
 
334 aa  409  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  59.88 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  59.45 
 
 
336 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  55.18 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  57.4 
 
 
361 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  58.01 
 
 
336 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  54.86 
 
 
340 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  54.68 
 
 
385 aa  381  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  56.8 
 
 
359 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  56.5 
 
 
359 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  56.8 
 
 
359 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  53.75 
 
 
335 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.47 
 
 
348 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  53.75 
 
 
335 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  51.4 
 
 
364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  50.15 
 
 
335 aa  361  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  50.15 
 
 
335 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  53.01 
 
 
335 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  50.15 
 
 
335 aa  359  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  49.85 
 
 
336 aa  358  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  50.91 
 
 
335 aa  358  9e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  53.17 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  49.85 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  50.45 
 
 
336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  49.85 
 
 
336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.15 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
336 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
335 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
335 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
335 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
335 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
335 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  49.39 
 
 
335 aa  352  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  48.94 
 
 
336 aa  350  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  49.55 
 
 
336 aa  350  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  52.42 
 
 
334 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  49.85 
 
 
338 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.65 
 
 
342 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  56.75 
 
 
344 aa  338  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  49.1 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  50.61 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  48.94 
 
 
362 aa  323  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50.74 
 
 
345 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  48.5 
 
 
487 aa  322  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  50.15 
 
 
344 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  47.89 
 
 
439 aa  316  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.33 
 
 
389 aa  311  7.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  47.6 
 
 
378 aa  306  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  49.85 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  49.7 
 
 
344 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.22 
 
 
343 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.11 
 
 
343 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  44.12 
 
 
481 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  44.41 
 
 
480 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.6 
 
 
326 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  45.92 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 
480 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  57.02 
 
 
246 aa  281  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  44.44 
 
 
478 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.95 
 
 
334 aa  277  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.34 
 
 
331 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  43.69 
 
 
456 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  44.44 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  44.16 
 
 
482 aa  272  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.84 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.35 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.82 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 
471 aa  268  8e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  44.48 
 
 
482 aa  267  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  42.31 
 
 
482 aa  265  8.999999999999999e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.95 
 
 
370 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.09 
 
 
333 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40 
 
 
330 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.52 
 
 
336 aa  260  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40.06 
 
 
330 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.11 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.9 
 
 
326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.67 
 
 
339 aa  258  7e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  42.48 
 
 
483 aa  259  7e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.67 
 
 
339 aa  258  9e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.86 
 
 
338 aa  258  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 
472 aa  258  1e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.72 
 
 
337 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40.06 
 
 
330 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.07 
 
 
339 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  39.29 
 
 
330 aa  256  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  43.06 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40.48 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.99 
 
 
325 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.99 
 
 
321 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.19 
 
 
336 aa  250  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.7 
 
 
342 aa  248  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.99 
 
 
329 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>