More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05190 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  100 
 
 
454 aa  889    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  38.57 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  37.67 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  38.98 
 
 
538 aa  298  9e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  39.49 
 
 
468 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  35.55 
 
 
499 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  37.9 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  35.23 
 
 
554 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  34.79 
 
 
490 aa  276  6e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  36.56 
 
 
525 aa  276  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  36.05 
 
 
500 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
518 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  34.34 
 
 
500 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  36.46 
 
 
481 aa  269  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  33.91 
 
 
485 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  33.4 
 
 
498 aa  262  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  34.48 
 
 
500 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  34.85 
 
 
462 aa  254  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  33.64 
 
 
451 aa  237  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.36 
 
 
460 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  32.97 
 
 
477 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  30.68 
 
 
460 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  30.69 
 
 
462 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  31.09 
 
 
455 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  30.44 
 
 
505 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  31.9 
 
 
445 aa  216  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
448 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  31.22 
 
 
453 aa  205  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30.97 
 
 
461 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.97 
 
 
448 aa  199  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  33.57 
 
 
458 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
461 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  32.26 
 
 
475 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
448 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
521 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  31.57 
 
 
458 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  31.18 
 
 
458 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.19 
 
 
496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  32.99 
 
 
469 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.07 
 
 
464 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  29.4 
 
 
446 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  30.91 
 
 
459 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.07 
 
 
470 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  31.85 
 
 
463 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  28.85 
 
 
492 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
456 aa  176  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30.28 
 
 
486 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.12 
 
 
462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  31.13 
 
 
503 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.37 
 
 
454 aa  172  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
466 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.94 
 
 
463 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.14 
 
 
484 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  30.28 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  30 
 
 
442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.47 
 
 
475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.74 
 
 
482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  31.27 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  27.23 
 
 
469 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.23 
 
 
469 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.23 
 
 
469 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.23 
 
 
469 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  27.6 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.04 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  27.02 
 
 
469 aa  163  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  30.9 
 
 
464 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.76 
 
 
477 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  31.16 
 
 
464 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  27.43 
 
 
475 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
453 aa  161  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
475 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
469 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
468 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.02 
 
 
469 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
480 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.92 
 
 
463 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
455 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
469 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
469 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
446 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  29.46 
 
 
438 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  29 
 
 
453 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  27.68 
 
 
471 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
461 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  29.52 
 
 
453 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  27.39 
 
 
491 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
454 aa  153  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  29.66 
 
 
438 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
438 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
455 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.5 
 
 
443 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
455 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
457 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  29.9 
 
 
480 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>