More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0908 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  39.15 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 		 213 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  37.97 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 215 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  36.07 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  36.31 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  36.07 
 
 		 211 aa  85.1  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 215 aa  85.1  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  34.78 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  30.3 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  32.31 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.11 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  28.57 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  42.55 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 174 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.09 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  31.75 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  32.11 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  27.17 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  23.83 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  26.15 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  29.68 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.67 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.08 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  25.36 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.95 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  27.96 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.95 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>