257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0446 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  93.62 
 
 		 2741 aa  4878    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 2741 aa  5397    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 916 aa  220  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1162 aa  207  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 1162 aa  207  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1060 aa  204  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 828 aa  199  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1025 aa  181  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 729 aa  180  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 		 991 aa  178  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  33.73 
 
 		 717 aa  170  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.48 
 
 		 1009 aa  166  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.29 
 
 		 957 aa  145  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  34.81 
 
 		 532 aa  145  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.32 
 
 		 1266 aa  140  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.39 
 
 		 809 aa  140  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 923 aa  138  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 949 aa  137  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 854 aa  135  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1711 aa  135  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  24.97 
 
 		 903 aa  129  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 937 aa  123  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  26.76 
 
 		 847 aa  114  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 868 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1409 aa  107  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.26 
 
 		 1328 aa  108  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  24.52 
 
 		 1219 aa  108  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  24.47 
 
 		 893 aa  107  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 1365 aa  107  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 		 968 aa  105  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 885 aa  104  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 994 aa  103  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.45 
 
 		 854 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.46 
 
 		 919 aa  103  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 851 aa  103  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 868 aa  102  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1215 aa  101  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 1779 aa  101  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  24.45 
 
 		 944 aa  100  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.79 
 
 		 884 aa  100  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1621 aa  101  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  29.06 
 
 		 891 aa  99  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.96 
 
 		 840 aa  99  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 1247 aa  99.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  24.86 
 
 		 950 aa  99  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  24.86 
 
 		 950 aa  98.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  24.02 
 
 		 959 aa  97.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.67 
 
 		 853 aa  97.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  33.01 
 
 		 874 aa  97.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1544 aa  97.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 846 aa  97.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  28.06 
 
 		 845 aa  96.3  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 796 aa  94  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 1054 aa  93.2  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 905 aa  92.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 905 aa  92.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 851 aa  90.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 822 aa  89.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.89 
 
 		 989 aa  89.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 1186 aa  89  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  26.05 
 
 		 960 aa  88.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1051 aa  83.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1247 aa  83.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  31.1 
 
 		 827 aa  83.2  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1276 aa  82.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  28.57 
 
 		 447 aa  82.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.81 
 
 		 782 aa  80.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  33.64 
 
 		 565 aa  80.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 		 904 aa  80.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 883 aa  80.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  46.15 
 
 		 1507 aa  79.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.93 
 
 		 1007 aa  79.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.95 
 
 		 1650 aa  78.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.74 
 
 		 418 aa  78.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.8 
 
 		 1135 aa  77.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1526 aa  77.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  29.76 
 
 		 811 aa  77.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  24.4 
 
 		 918 aa  77.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1055 aa  77.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.69 
 
 		 3298 aa  77.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  38.79 
 
 		 1475 aa  77.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  34.67 
 
 		 595 aa  76.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  21.03 
 
 		 909 aa  75.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.35 
 
 		 1238 aa  75.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  30.21 
 
 		 521 aa  75.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  32.86 
 
 		 873 aa  75.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  31.07 
 
 		 848 aa  74.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.23 
 
 		 3535 aa  75.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.23 
 
 		 3419 aa  74.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.85 
 
 		 937 aa  74.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  27.56 
 
 		 905 aa  73.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  33.12 
 
 		 398 aa  73.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  31.13 
 
 		 890 aa  73.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.5 
 
 		 3299 aa  73.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  26.3 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1077 aa  72.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  30.19 
 
 		 890 aa  72.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  32.37 
 
 		 883 aa  71.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  34.12 
 
 		 934 aa  71.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1246 aa  72  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>