More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3490 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 950 aa  1840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 998 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 956 aa  131  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  27.28 
 
 		 928 aa  98.6  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 959 aa  90.9  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.5 
 
 		 1006 aa  89.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 1015 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 1030 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 895 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  31.81 
 
 		 981 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.8 
 
 		 1022 aa  83.2  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.18 
 
 		 983 aa  82.4  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 1005 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  30.73 
 
 		 977 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 973 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.13 
 
 		 1034 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.19 
 
 		 919 aa  77.8  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 		 967 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 954 aa  75.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.96 
 
 		 1441 aa  75.1  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  27.87 
 
 		 937 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 1198 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 948 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.39 
 
 		 993 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.03 
 
 		 1122 aa  70.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 947 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.57 
 
 		 1295 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 		 992 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 1085 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 		 1271 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  45.88 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 982 aa  67.8  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  28.84 
 
 		 1013 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  62.71 
 
 		 879 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  26.56 
 
 		 916 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  48.65 
 
 		 887 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.57 
 
 		 1175 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 927 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 234 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.8 
 
 		 1150 aa  65.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 		 973 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.55 
 
 		 955 aa  65.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  42.55 
 
 		 1085 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 1644 aa  65.1  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 1137 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  25.64 
 
 		 1133 aa  65.1  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.67 
 
 		 1029 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.58 
 
 		 1429 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 995 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  48.39 
 
 		 917 aa  63.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 178 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 175 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 876 aa  63.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 910 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 900 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 178 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  50 
 
 		 176 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 929 aa  63.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 1422 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 921 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  26.54 
 
 		 921 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  30.23 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.05 
 
 		 1118 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.51 
 
 		 1422 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 775 aa  62  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 894 aa  61.6  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  29.28 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  55.74 
 
 		 1089 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  26.54 
 
 		 921 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 979 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 845 aa  61.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 219 aa  61.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 938 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  54.69 
 
 		 901 aa  60.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 215 aa  60.1  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.38 
 
 		 242 aa  60.1  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 229 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 222 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 228 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 1141 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  23.81 
 
 		 1169 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 1141 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 226 aa  60.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  38.1 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  48.21 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 953 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 1403 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  55.77 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.79 
 
 		 913 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 1141 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>