More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1398 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  82.54 
 
 		 191 aa  330  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 191 aa  293  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  71.2 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  51.6 
 
 		 194 aa  201  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 437 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  31.87 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  25.64 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 264 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 273 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  26.14 
 
 		 253 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  38.36 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.96 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 251 aa  51.2  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 244 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 250 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>