141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4926 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  100 
 
 
748 aa  1506    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  47.58 
 
 
723 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  47.32 
 
 
755 aa  320  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  48.54 
 
 
1148 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  60.22 
 
 
726 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  66.91 
 
 
1049 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  26.16 
 
 
576 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  36.77 
 
 
806 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  37.67 
 
 
806 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  36.77 
 
 
806 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  36.77 
 
 
806 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  37.67 
 
 
806 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.67 
 
 
806 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.77 
 
 
806 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  34.98 
 
 
806 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07117  conserved hypothetical protein  26.93 
 
 
458 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.78 
 
 
790 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  39.72 
 
 
1016 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  26.57 
 
 
672 aa  87.8  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  39.86 
 
 
794 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 
805 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  30.07 
 
 
807 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 
858 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 
800 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 
858 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 
800 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  24.92 
 
 
809 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  24.92 
 
 
809 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.09 
 
 
1577 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 
858 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  38.36 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  30.92 
 
 
737 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.65 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  39.07 
 
 
647 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.49 
 
 
648 aa  73.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.9 
 
 
474 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.78 
 
 
500 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.33 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  35.34 
 
 
1567 aa  68.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  28.81 
 
 
963 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  36.36 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  35.61 
 
 
472 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.89 
 
 
514 aa  65.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.43 
 
 
466 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  33.08 
 
 
468 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  35.61 
 
 
801 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.29 
 
 
401 aa  65.1  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35 
 
 
756 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  31.09 
 
 
491 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  30.43 
 
 
547 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  36.09 
 
 
514 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  36.89 
 
 
618 aa  62.4  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  34.51 
 
 
495 aa  62.4  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.33 
 
 
493 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.04 
 
 
507 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  22.89 
 
 
1323 aa  62  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  31.85 
 
 
576 aa  62  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.85 
 
 
498 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  32.61 
 
 
427 aa  60.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  23.33 
 
 
644 aa  60.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  42.99 
 
 
497 aa  61.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.51 
 
 
507 aa  60.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.8 
 
 
884 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.6 
 
 
1139 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  33.8 
 
 
412 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  32.61 
 
 
461 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.86 
 
 
691 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  31.01 
 
 
172 aa  60.1  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  31.65 
 
 
1100 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.53 
 
 
943 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  35.29 
 
 
492 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.32 
 
 
510 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1740  hypothetical protein  22.76 
 
 
885 aa  58.9  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  36.43 
 
 
1222 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  28.77 
 
 
482 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.99 
 
 
474 aa  58.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  34.62 
 
 
374 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  32.33 
 
 
487 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  37.9 
 
 
560 aa  57.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  26.67 
 
 
957 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  33.82 
 
 
535 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.58 
 
 
493 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  34.45 
 
 
663 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.41 
 
 
1072 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  33.56 
 
 
574 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  38.37 
 
 
603 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  33.1 
 
 
569 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  30.36 
 
 
230 aa  55.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  28.28 
 
 
1259 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.94 
 
 
489 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  32.58 
 
 
430 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  31.82 
 
 
240 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  34.51 
 
 
897 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  29.93 
 
 
571 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  32.39 
 
 
567 aa  54.3  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  36.97 
 
 
489 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  29.17 
 
 
483 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.21 
 
 
566 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.97 
 
 
520 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  27.46 
 
 
1187 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>