More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2997 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
708 aa  1438  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  46.58 
 
 
732 aa  575  1e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  50.08 
 
 
754 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  47.91 
 
 
619 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  46.98 
 
 
598 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  47.83 
 
 
833 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  52.15 
 
 
833 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  47.5 
 
 
754 aa  541  1e-152  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  48.98 
 
 
828 aa  532  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  49.4 
 
 
828 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  45.18 
 
 
789 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  47.68 
 
 
626 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  49.48 
 
 
828 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  50.35 
 
 
595 aa  518  1e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  43.88 
 
 
824 aa  515  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 
789 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 
718 aa  406  1e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  35.76 
 
 
708 aa  375  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  42.15 
 
 
585 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.69 
 
 
589 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
713 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.33 
 
 
589 aa  356  9e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.23 
 
 
1106 aa  356  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
717 aa  349  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  39.04 
 
 
776 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  39.04 
 
 
776 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  39.04 
 
 
776 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  39.04 
 
 
821 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  38.87 
 
 
821 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 
776 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 
776 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  38.34 
 
 
1106 aa  344  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 
717 aa  343  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  36.18 
 
 
596 aa  338  2e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  34.73 
 
 
699 aa  337  6e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  35.29 
 
 
1221 aa  329  1e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 
968 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
1085 aa  324  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.56 
 
 
715 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
627 aa  323  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  32.96 
 
 
1415 aa  322  2e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  37.48 
 
 
797 aa  321  2e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
633 aa  321  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.82 
 
 
739 aa  314  5e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.41 
 
 
529 aa  313  6e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
1714 aa  313  6e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
693 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.67 
 
 
723 aa  305  2e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 
796 aa  304  3e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.08 
 
 
790 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.55 
 
 
937 aa  300  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
734 aa  300  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 
667 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  36.76 
 
 
781 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  36.1 
 
 
790 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
750 aa  290  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
3560 aa  290  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.96 
 
 
780 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
780 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
700 aa  287  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.39 
 
 
739 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
822 aa  286  1e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.59 
 
 
739 aa  284  4e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.18 
 
 
742 aa  283  5e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.35 
 
 
740 aa  283  6e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.54 
 
 
816 aa  283  7e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
4489 aa  282  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
909 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
727 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
1143 aa  277  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
1094 aa  276  1e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
3035 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
779 aa  271  3e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
654 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
739 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
633 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
647 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  33.27 
 
 
921 aa  264  5e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
732 aa  253  9e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
733 aa  251  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  33.4 
 
 
1116 aa  251  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
808 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 
1144 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
632 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
706 aa  240  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
611 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
667 aa  236  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
761 aa  231  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  27.74 
 
 
680 aa  231  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  31.86 
 
 
552 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
974 aa  228  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
647 aa  228  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
574 aa  223  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
750 aa  221  4e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
724 aa  213  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
740 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  35.83 
 
 
492 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
590 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  32.96 
 
 
590 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 
618 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>