More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3255 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3255  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
354 aa  717  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00360912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2011  AAA-4 family protein  40.69 
 
 
342 aa  253  4e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0044  hypothetical protein  31.4 
 
 
189 aa  77  4e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
465 aa  68.9  1e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.22 
 
 
1138 aa  68.6  2e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
1276 aa  68.2  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
366 aa  64.7  2e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
329 aa  64.3  3e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
927 aa  63.9  4e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.2 
 
 
417 aa  63.5  5e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.01 
 
 
397 aa  61.6  2e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
326 aa  61.6  2e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 
632 aa  61.2  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
3035 aa  60.1  6e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
620 aa  60.1  6e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
761 aa  59.7  7e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  28.66 
 
 
603 aa  59.7  7e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 
1979 aa  59.7  8e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 
553 aa  59.7  8e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.84 
 
 
620 aa  59.3  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 
330 aa  58.2  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
467 aa  58.5  2e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
202 aa  58.5  2e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 
296 aa  58.5  2e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
4079 aa  57.8  3e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.7 
 
 
1237 aa  57  5e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
711 aa  56.6  6e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
543 aa  56.6  6e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
402 aa  56.6  7e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.71 
 
 
560 aa  56.6  7e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26.14 
 
 
623 aa  56.2  8e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
716 aa  56.2  8e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
471 aa  56.2  9e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.02 
 
 
689 aa  55.8  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
289 aa  55.8  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
654 aa  55.5  1e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
1297 aa  55.5  1e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.87 
 
 
732 aa  55.5  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
1094 aa  55.8  1e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 
576 aa  55.1  2e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.97 
 
 
810 aa  54.7  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 
297 aa  54.3  3e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3560 aa  54.7  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 
297 aa  54.3  3e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
699 aa  54.3  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
884 aa  54.7  3e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
1272 aa  54.7  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
562 aa  53.9  4e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
523 aa  53.9  4e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
878 aa  53.9  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  20.13 
 
 
592 aa  54.3  4e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  22.58 
 
 
314 aa  53.9  4e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
602 aa  53.9  4e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
465 aa  53.9  4e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.68 
 
 
292 aa  53.5  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 
451 aa  53.5  5e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.52 
 
 
573 aa  53.5  5e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
639 aa  53.5  5e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.22 
 
 
730 aa  53.1  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
1069 aa  53.1  7e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 
369 aa  53.1  8e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
767 aa  52.8  9e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 
784 aa  52.4  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
244 aa  52.8  1e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
621 aa  52.4  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.29 
 
 
745 aa  52.8  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
935 aa  52.4  1e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
279 aa  52.4  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
596 aa  52.8  1e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2066  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
257 aa  52.4  1e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.585101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
1421 aa  52.4  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  24.07 
 
 
475 aa  52.8  1e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  28.95 
 
 
191 aa  52.4  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.79 
 
 
635 aa  51.6  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
750 aa  51.2  2e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
311 aa  51.2  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
311 aa  51.6  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 
2262 aa  51.6  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
4489 aa  51.6  2e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 
643 aa  51.6  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.08 
 
 
462 aa  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.11 
 
 
564 aa  51.6  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.34 
 
 
308 aa  51.2  2e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
435 aa  51.6  2e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  34.34 
 
 
584 aa  50.8  3e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.56 
 
 
743 aa  50.8  3e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.4 
 
 
695 aa  50.8  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.83 
 
 
681 aa  50.8  3e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
450 aa  51.2  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
2262 aa  50.8  3e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
636 aa  50.8  4e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 
436 aa  50.8  4e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.41 
 
 
795 aa  50.8  4e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
213 aa  50.4  5e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 
1067 aa  50.4  5e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
870 aa  50.4  5e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.49301e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  23.94 
 
 
260 aa  50.1  5e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
594 aa  50.4  5e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.35 
 
 
579 aa  50.1  5e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.9 
 
 
676 aa  50.1  6e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>