More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3255 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3255  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 354 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2011  AAA-4 family protein  40.69 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0044  hypothetical protein  31.4 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1138 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1276 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 927 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.2 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.01 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 620 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 3035 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 761 aa  59.7  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  28.66 
 
 		 603 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 		 1979 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 		 553 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.84 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 4079 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.7 
 
 		 1237 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 711 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.71 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26.14 
 
 		 623 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1297 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.87 
 
 		 732 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1094 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.02 
 
 		 689 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 654 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.97 
 
 		 810 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 		 576 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1272 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 699 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3560 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 884 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 562 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  20.13 
 
 		 592 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 878 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 523 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 602 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 465 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  22.58 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.68 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 451 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.52 
 
 		 573 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 639 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1069 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.22 
 
 		 730 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 767 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  28.95 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2066  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.585101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 935 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 784 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  24.07 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 596 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.29 
 
 		 745 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1421 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 621 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.34 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 4489 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 750 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.79 
 
 		 635 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 643 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.08 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 2262 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.11 
 
 		 564 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.4 
 
 		 695 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.56 
 
 		 743 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  34.34 
 
 		 584 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 2262 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.83 
 
 		 681 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.41 
 
 		 795 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 636 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 594 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 		 1067 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 213 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  23.94 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 870 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.35 
 
 		 579 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  24.16 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>