More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2011 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2011  AAA-4 family protein  100 
 
 
342 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3255  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 
354 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00360912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25.93 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
1121 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1069 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  33.58 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
1276 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
523 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
654 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
716 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.15 
 
 
623 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.91 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 
927 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.94 
 
 
836 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0044  hypothetical protein  29.7 
 
 
189 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.09 
 
 
1694 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 
1979 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.63 
 
 
1007 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.27 
 
 
1013 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
1192 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.94 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.36 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
3035 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 
784 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
602 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.33 
 
 
297 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
4079 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
3560 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1406 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.33 
 
 
297 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.91 
 
 
573 aa  59.3  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
711 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.17 
 
 
730 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
1038 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.62 
 
 
1138 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.13 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
935 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 
523 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
636 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
4489 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
634 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
202 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.67 
 
 
715 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
395 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
162 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.19 
 
 
581 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1056 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
662 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
213 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 
818 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
465 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  28.24 
 
 
191 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
1297 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
740 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 
1022 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 
564 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
162 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
1094 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  25.4 
 
 
743 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
612 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
562 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
245 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
636 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
452 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
217 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
639 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  30.36 
 
 
198 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
740 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
1827 aa  53.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
388 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
2262 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
708 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
388 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 
123 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
317 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  26.62 
 
 
1056 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 
123 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  30.61 
 
 
1004 aa  53.1  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
611 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  33.72 
 
 
391 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
637 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
635 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
512 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
635 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
955 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 
190 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
713 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 
632 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
520 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  27.61 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>