More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1130 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 566 aa  1170    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  62.96 
 
 		 589 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  48.92 
 
 		 596 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  51.92 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  51.77 
 
 		 688 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  50.53 
 
 		 914 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  46.42 
 
 		 612 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  49.06 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  44 
 
 		 605 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  48.08 
 
 		 679 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  43.68 
 
 		 563 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  42.39 
 
 		 738 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  44.81 
 
 		 661 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  40.92 
 
 		 614 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  39.83 
 
 		 722 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  38.92 
 
 		 1888 aa  357  3.9999999999999996e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  40.66 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  43.43 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  43.7 
 
 		 707 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  38.8 
 
 		 722 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  39.52 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.22 
 
 		 2156 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  29.64 
 
 		 453 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  29.9 
 
 		 453 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  29.05 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  27.8 
 
 		 449 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.88 
 
 		 449 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  29.32 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  43.4 
 
 		 218 aa  94.7  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  49.5 
 
 		 661 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  26.05 
 
 		 441 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.29 
 
 		 458 aa  86.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.14 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  25.52 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  29.59 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  47.56 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  46.67 
 
 		 881 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  45.56 
 
 		 881 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  45.56 
 
 		 882 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  45.56 
 
 		 882 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  43.88 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  37 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  36.69 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  22.49 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  27 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.79 
 
 		 620 aa  68.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  41.03 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26014  predicted protein  40.48 
 
 		 249 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  25.4 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.01 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  26.61 
 
 		 712 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  28.5 
 
 		 727 aa  63.9  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  27.67 
 
 		 606 aa  63.9  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  27.67 
 
 		 606 aa  63.9  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  31.88 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  32.93 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  39.13 
 
 		 619 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  33.09 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  30.28 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 509 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  31.88 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  31.65 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  25.89 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.78 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  28.79 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  29.19 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 		 521 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  29.19 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  26.32 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  36.99 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  23.02 
 
 		 1021 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  25.89 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  22.73 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  31.3 
 
 		 526 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  30.86 
 
 		 733 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.58 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  26.85 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  27.32 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.67 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  26.44 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  31.25 
 
 		 722 aa  58.9  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.17 
 
 		 807 aa  58.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.9 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  23.46 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  26.98 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  27.85 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  28.33 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  33.59 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  20.93 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  25.45 
 
 		 785 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.52 
 
 		 1891 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  26.52 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>