271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0768 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  380  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0700851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  69.57 
 
 		 693 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  82.43 
 
 		 1466 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  69.57 
 
 		 1492 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0772  RHS protein  100 
 
 		 327 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.728642  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  40.86 
 
 		 1487 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  55.56 
 
 		 1620 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  36.22 
 
 		 1400 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  70.18 
 
 		 1609 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  70.18 
 
 		 1348 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  54.76 
 
 		 1626 aa  94.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  68.97 
 
 		 867 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  64.91 
 
 		 598 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  42.34 
 
 		 1547 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  64.52 
 
 		 1583 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  66.1 
 
 		 1573 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  57.33 
 
 		 1611 aa  90.9  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  72.73 
 
 		 306 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  64.91 
 
 		 1359 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  63.79 
 
 		 1543 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  64.91 
 
 		 1362 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  63.79 
 
 		 1552 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  64.91 
 
 		 1409 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  63.16 
 
 		 1576 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  65.52 
 
 		 1560 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  65.52 
 
 		 1494 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  57.75 
 
 		 1568 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  52.44 
 
 		 1418 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  63.79 
 
 		 1572 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  51.25 
 
 		 1527 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  57.14 
 
 		 1379 aa  89  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  61.02 
 
 		 1586 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0521  Rhs family protein-like protein  69.64 
 
 		 230 aa  87.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  61.02 
 
 		 1595 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  57.35 
 
 		 1390 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  61.67 
 
 		 1654 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  61.67 
 
 		 1388 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  60.66 
 
 		 480 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  63.16 
 
 		 451 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  64.91 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  59.38 
 
 		 1593 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  58.82 
 
 		 307 aa  86.3  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  59.32 
 
 		 1614 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  59.32 
 
 		 357 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  43.24 
 
 		 1422 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  60.66 
 
 		 1386 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  67.86 
 
 		 924 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  63.16 
 
 		 561 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  41.67 
 
 		 1410 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  63.79 
 
 		 414 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  51.35 
 
 		 1410 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3695  hypothetical protein  69.09 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.63687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  53.09 
 
 		 1586 aa  84.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  61.4 
 
 		 1550 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  51.28 
 
 		 1411 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  51.28 
 
 		 1411 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  51.28 
 
 		 1411 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  46.84 
 
 		 1385 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  51.28 
 
 		 1411 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  67.27 
 
 		 1419 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  51.28 
 
 		 1411 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  57.14 
 
 		 1189 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  62.07 
 
 		 866 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  35.82 
 
 		 1551 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  51.28 
 
 		 1411 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  62.5 
 
 		 1604 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  59.65 
 
 		 1770 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  59.65 
 
 		 1531 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  57.89 
 
 		 1384 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  35.82 
 
 		 583 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  59.32 
 
 		 1520 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  62.5 
 
 		 553 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  63.16 
 
 		 1397 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  63.16 
 
 		 1397 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  63.16 
 
 		 1397 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  63.16 
 
 		 1397 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3343  RHS protein  60.71 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3884  RHS protein  59.65 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  57.89 
 
 		 1539 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  57.89 
 
 		 1554 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  57.89 
 
 		 1539 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  58.62 
 
 		 1579 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  62.5 
 
 		 1402 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  55.93 
 
 		 1602 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  63.16 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  63.16 
 
 		 1377 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  57.89 
 
 		 1411 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1825  Rhs family protein  67.27 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.337988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  34.27 
 
 		 1423 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  63.16 
 
 		 1377 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  59.65 
 
 		 1525 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  58.93 
 
 		 1679 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  61.4 
 
 		 1308 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  61.4 
 
 		 1405 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  57.63 
 
 		 1399 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  42.48 
 
 		 1409 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  59.65 
 
 		 1426 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  43.36 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  59.65 
 
 		 1426 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  42.48 
 
 		 1388 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>