287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0521 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0521  Rhs family protein-like protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  59.02 
 
 		 1379 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  89.9 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  90.91 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  59 
 
 		 1418 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  59.18 
 
 		 1390 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  48.84 
 
 		 1402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  55.56 
 
 		 1419 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  59.18 
 
 		 867 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  55.21 
 
 		 1409 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  49.58 
 
 		 171 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  54.08 
 
 		 1348 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  52.58 
 
 		 1609 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  45.16 
 
 		 1531 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  39.77 
 
 		 451 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  46.43 
 
 		 1400 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3695  hypothetical protein  67.09 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.63687  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  54.74 
 
 		 1410 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  53.68 
 
 		 480 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 1583 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  48.45 
 
 		 1573 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  36.42 
 
 		 598 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  53.12 
 
 		 1359 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  44.23 
 
 		 1530 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  39.85 
 
 		 561 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3884  RHS protein  49.48 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  49.48 
 
 		 1595 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0772  RHS protein  53.54 
 
 		 327 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.728642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  49.51 
 
 		 1560 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  53 
 
 		 1362 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  49.48 
 
 		 1586 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  47.47 
 
 		 1547 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1411 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  37.84 
 
 		 924 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3343  RHS protein  45.3 
 
 		 384 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  46.67 
 
 		 414 aa  98.6  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  52.53 
 
 		 1492 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  52.53 
 
 		 1466 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  49.49 
 
 		 866 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  52.53 
 
 		 693 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  48.96 
 
 		 1386 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  45.83 
 
 		 1626 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  47.47 
 
 		 1527 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  51.55 
 
 		 1572 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  47 
 
 		 1620 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  52.58 
 
 		 1611 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  45.87 
 
 		 1654 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  46.39 
 
 		 1568 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  48.98 
 
 		 1576 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  69.84 
 
 		 1586 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  48.42 
 
 		 1385 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  36.62 
 
 		 1384 aa  91.7  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  44.55 
 
 		 583 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  44.76 
 
 		 1770 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  44.55 
 
 		 1551 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  40 
 
 		 1421 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  48.42 
 
 		 1791 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  60.32 
 
 		 1494 aa  89  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  39.06 
 
 		 357 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  68.33 
 
 		 1604 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  47 
 
 		 1614 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  64.52 
 
 		 553 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  42.28 
 
 		 1677 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  34.73 
 
 		 1550 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0768  hypothetical protein  69.64 
 
 		 181 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0700851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  35.19 
 
 		 690 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  38.28 
 
 		 1554 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  42.2 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  42.2 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  42.2 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  44 
 
 		 1520 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  59.68 
 
 		 1446 aa  85.1  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  28.63 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  44.33 
 
 		 1410 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  41.28 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  46.88 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  36.36 
 
 		 1308 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1397 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  27.76 
 
 		 1397 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  27.76 
 
 		 1397 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  44.94 
 
 		 1679 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3340  hypothetical protein  62.71 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  59.32 
 
 		 1541 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1552 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 1189 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  44.44 
 
 		 1543 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  56.52 
 
 		 1527 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  28.22 
 
 		 1397 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  42.7 
 
 		 1593 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  43.75 
 
 		 1539 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  43.75 
 
 		 1539 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  44 
 
 		 1398 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  40.37 
 
 		 1388 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  57.63 
 
 		 1381 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  57.63 
 
 		 1541 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  57.63 
 
 		 1541 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  57.63 
 
 		 1541 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  57.63 
 
 		 1541 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  57.63 
 
 		 1541 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  44.33 
 
 		 927 aa  79  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>