More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3695 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3695  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.63687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  85.56 
 
 		 1419 aa  328  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  43.31 
 
 		 1390 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  76.47 
 
 		 1418 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  41.67 
 
 		 1609 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  65.85 
 
 		 1402 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  80.65 
 
 		 1379 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.83 
 
 		 306 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  75.81 
 
 		 1531 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  77.42 
 
 		 1359 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  80.65 
 
 		 307 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  56.32 
 
 		 1586 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  49.53 
 
 		 1400 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  75.41 
 
 		 1348 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  68.75 
 
 		 1595 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  72.31 
 
 		 1576 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  75.81 
 
 		 1611 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  58.02 
 
 		 1560 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  71.64 
 
 		 867 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  41.42 
 
 		 1604 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3343  RHS protein  76.67 
 
 		 384 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0521  Rhs family protein-like protein  67.09 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  76.67 
 
 		 1654 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  74.19 
 
 		 1583 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  71.43 
 
 		 1572 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  74.19 
 
 		 1409 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  58.75 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  67.16 
 
 		 1421 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  72.58 
 
 		 1362 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  57.14 
 
 		 1614 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  64.38 
 
 		 1446 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  57.83 
 
 		 598 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  70.49 
 
 		 924 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  70.31 
 
 		 451 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  69.23 
 
 		 1573 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  60.27 
 
 		 1568 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3884  RHS protein  67.74 
 
 		 231 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0772  RHS protein  54.95 
 
 		 327 aa  99  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.728642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  44.54 
 
 		 480 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  71.67 
 
 		 1386 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  68.85 
 
 		 1620 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  66.67 
 
 		 1527 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  62.3 
 
 		 1494 aa  95.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  55.13 
 
 		 1554 aa  94.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  55 
 
 		 1626 aa  94.4  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  68.25 
 
 		 1466 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  70 
 
 		 1385 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  64.06 
 
 		 561 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  69.35 
 
 		 1492 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  64.71 
 
 		 693 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  65.57 
 
 		 1551 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  67.74 
 
 		 1411 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  38.96 
 
 		 1699 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  53.95 
 
 		 414 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  65.57 
 
 		 583 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  63.49 
 
 		 1520 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  70.49 
 
 		 1586 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  62.71 
 
 		 1547 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  60 
 
 		 866 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  60.94 
 
 		 1550 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  66.13 
 
 		 1410 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  61.29 
 
 		 1384 aa  90.5  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  59.68 
 
 		 357 aa  88.6  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3340  hypothetical protein  68.42 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  55.13 
 
 		 1189 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  49.56 
 
 		 1433 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  62.3 
 
 		 553 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  62.3 
 
 		 1508 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  60.32 
 
 		 1602 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0645  Rhs core protein  50.68 
 
 		 444 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.746843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  60.32 
 
 		 1770 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  50 
 
 		 1552 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  39.6 
 
 		 1593 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  50 
 
 		 1543 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0768  hypothetical protein  69.09 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0700851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  52.78 
 
 		 1530 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  55.74 
 
 		 1541 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  55.74 
 
 		 1381 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  61.67 
 
 		 1527 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  55.74 
 
 		 1541 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  55.74 
 
 		 1541 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  55.74 
 
 		 1541 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  55.74 
 
 		 1541 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  55.74 
 
 		 1541 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  62.3 
 
 		 1423 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  49.32 
 
 		 1600 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  60.66 
 
 		 1495 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  61.02 
 
 		 1505 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  59.68 
 
 		 1410 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  56.92 
 
 		 931 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  46.99 
 
 		 1539 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  46.99 
 
 		 1539 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  60.66 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  53.52 
 
 		 1679 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  60.66 
 
 		 1415 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  61.9 
 
 		 1388 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0368  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  59.02 
 
 		 1200 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  59.02 
 
 		 682 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  59.02 
 
 		 1216 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>