More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2073 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2073  UspA domain protein  100 
 
 		 161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  36.48 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  36.42 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.55 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  34.59 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.54 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.3 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.19 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  33.95 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.73 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  31.33 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.06 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.18 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.43 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  31.65 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.87 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  28.48 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.29 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  31.29 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.67 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.08 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  31.65 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.12 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  30.19 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  33.74 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.85 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.44 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.24 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  29.86 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.95 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.94 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.7 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32.1 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.59 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.22 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.45 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.54 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  30.86 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  28.3 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  31.68 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.49 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.5 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  29.22 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  28.75 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.75 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  27.67 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 449 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.25 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.04 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  26.71 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.75 
 
 		 290 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.39 
 
 		 305 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.67 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  30.18 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.96 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.93 
 
 		 288 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  24.38 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.04 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  27.71 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  35.96 
 
 		 348 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  28.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  44.3 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  30.91 
 
 		 310 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  47.17 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.1 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40.23 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  29.75 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.92 
 
 		 288 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  30.52 
 
 		 281 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.12 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.76 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>