More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1512 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  59.04 
 
 		 189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  46.81 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.21 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  46.24 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  47.31 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  48.35 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  45.21 
 
 		 188 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  48.28 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  39.67 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  34.76 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.19 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 414 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  41.1 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 530 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.36 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  28.18 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 544 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  34 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 678 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 318 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 325 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 535 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3525  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 305 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  33.75 
 
 		 298 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 292 aa  52.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4328  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 303 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 282 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  36.23 
 
 		 304 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 299 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  42.03 
 
 		 779 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 279 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  35.8 
 
 		 261 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4615  helix-turn-helix domain-containing protein  24.82 
 
 		 281 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00567057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 517 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 539 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 267 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 328 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 305 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 310 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 323 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 330 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 302 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 97 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 531 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 295 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>