95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6873 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.66 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  26.84 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  23.95 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 268 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 357 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 360 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 357 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 355 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  19.84 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 288 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 360 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  30.56 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 299 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 361 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.33 
 
 		 360 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 337 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  34.09 
 
 		 396 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 396 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3518  cyclic nucleotide-binding  34.92 
 
 		 319 aa  44.7  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 410 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  26.76 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 360 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1050  transcriptional regulator, AraC family  34.33 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  24.37 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  24.83 
 
 		 331 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 356 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 393 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 318 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 354 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 259 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2230  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 283 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 332 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 332 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 273 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 360 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 332 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  30.1 
 
 		 272 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  30.38 
 
 		 350 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 306 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  35 
 
 		 308 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  28.57 
 
 		 319 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 308 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 350 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 319 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 316 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  30.88 
 
 		 308 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 291 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 339 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 260 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 321 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0342  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 778 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 274 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 542 aa  41.2  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 338 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 305 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>