More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6868 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  65.43 
 
 		 188 aa  260  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  47.03 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.74 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  47.57 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  45.93 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 187 aa  161  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  45.5 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  42.44 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  36.36 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  32.95 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 186 aa  94.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.74 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 306 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 327 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.11 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 537 aa  58.9  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 779 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  31.78 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 440 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 508 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 294 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  43.94 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.91 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  39.19 
 
 		 493 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  35 
 
 		 530 aa  55.1  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 492 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 308 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 314 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 531 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 314 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 314 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 300 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 344 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 276 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 304 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.15 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 303 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 301 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 513 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 97 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 292 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 773 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 265 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>