More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6599 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  54.84 
 
 		 186 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  52.17 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  50.79 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  48.65 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  47.59 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  48.68 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  40.76 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  35.29 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 386 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 773 aa  62.4  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5635  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 282 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  0.936217 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 384 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  25.41 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 298 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  34.57 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  26.17 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  24.53 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  22.31 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  25.84 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 537 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  20.79 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  23.45 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 546 aa  54.7  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  25.18 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 539 aa  54.7  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  25.58 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 281 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  20.79 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 289 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 97 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 314 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0632  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 327 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0334632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 281 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 306 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.15 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 306 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 301 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 409 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 309 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00274  transcriptional regulator, AraC family protein  30.77 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 301 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4328  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 310 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11303 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 301 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 409 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 336 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 305 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>