More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2318 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 186 aa  232  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  42.86 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  39.67 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.41 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  31.76 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 150 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  35.44 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.71 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 302 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 369 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3907  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.869248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4950  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03436  putative regulatory protein  32.53 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03387  hypothetical protein  32.53 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 463 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 299 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 773 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3956  putative regulatory protein  30.77 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0244269  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.97 
 
 		 303 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  28.97 
 
 		 303 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 304 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 327 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 291 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 332 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3892  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4063  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.453209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 312 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3876  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 370 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4001  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.940351  normal  0.48087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  32.53 
 
 		 294 aa  51.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 282 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 318 aa  51.6  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 775 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  26.58 
 
 		 306 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 295 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 297 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 272 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 537 aa  51.2  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>