More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1500 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  50.56 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  47.31 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  48.92 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  50.55 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  47.34 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  42.22 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  46.63 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.68 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  39.25 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  38.37 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.16 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2714  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6699  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3644  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 302 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3601  response regulator receiver domain-containing protein  31.18 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4441  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 281 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 384 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 537 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 147 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  28.72 
 
 		 297 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 305 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 300 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 300 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 295 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 519 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 300 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 305 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 250 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 306 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  28.04 
 
 		 304 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4017  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 306 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176614  hitchhiker  0.00151279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 139 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 278 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 302 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 331 aa  51.6  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.59 
 
 		 1278 aa  51.2  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.5 
 
 		 299 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 519 aa  51.2  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 261 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 306 aa  51.2  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 365 aa  51.2  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 307 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 775 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 387 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 773 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  26.58 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 411 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 392 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 338 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 305 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 508 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 531 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.16 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 345 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 281 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2531  Ada, metal-binding  29.63 
 
 		 545 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.645313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  20.11 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 760 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.08 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>