111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11748 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.08 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  42.02 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  39.67 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  39.89 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  39.46 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  40.45 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  39.89 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  34.05 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  31.76 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.95 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 356 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 310 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 519 aa  48.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 359 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 331 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1288  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0436335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  23.68 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 322 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 319 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 343 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.91 
 
 		 537 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 311 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 319 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  24.27 
 
 		 298 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 288 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  21.64 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 299 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 299 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 534 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  21.98 
 
 		 291 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 305 aa  44.7  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.96 
 
 		 158 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 288 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 397 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 299 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 361 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  34.25 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 309 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 760 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  21.69 
 
 		 343 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 304 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  21.95 
 
 		 295 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 336 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  25.64 
 
 		 301 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  22.67 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  29 
 
 		 365 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 306 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 323 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 519 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 513 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 508 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  24.44 
 
 		 291 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 337 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  23.53 
 
 		 305 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 362 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 273 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 779 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 305 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 387 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 278 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  20.91 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 281 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  19.4 
 
 		 346 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  23.75 
 
 		 296 aa  41.2  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>