More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6643 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  55.21 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  38.17 
 
 		 187 aa  137  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.57 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  34.05 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.65 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 513 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.1 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  30 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 306 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 272 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  31.4 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 316 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 517 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 303 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 323 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 308 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 288 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 282 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  31.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  31.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4291  transcriptional activator RhaS  31.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 290 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  29.76 
 
 		 308 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 288 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  31.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  31.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0691  helix-turn-helix domain-containing protein  22.03 
 
 		 716 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 745 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 287 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 745 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0706  helix-turn-helix domain-containing protein  22.03 
 
 		 716 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 309 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 298 aa  51.6  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 304 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 291 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 293 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  32.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  32.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 384 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  32.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  32.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 508 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3977  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 301 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 1201 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  32.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 530 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.34 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 334 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.93 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 313 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  31.52 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 112 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>