More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0190 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  60.89 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  54.84 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  55.06 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  53.59 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  53.11 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  48.3 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  47.67 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  45.93 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  48.35 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  43.96 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  40.45 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.33 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 369 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 773 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  22.05 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  25.53 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 370 aa  54.7  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 305 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 548 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 305 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 305 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 312 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 386 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  31.28 
 
 		 412 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 293 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 305 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 365 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3977  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 301 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 301 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 346 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 329 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  22.73 
 
 		 306 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  33.33 
 
 		 387 aa  51.6  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 397 aa  51.6  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.94 
 
 		 385 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 306 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  22.54 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  27.54 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 299 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  21.1 
 
 		 261 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 542 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 396 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  38.18 
 
 		 296 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 411 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 291 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 288 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 285 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 322 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4001  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 271 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.940351  normal  0.48087 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2988  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 314 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 306 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 332 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 282 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 318 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4950  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 271 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4063  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 271 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.453209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 309 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03387  hypothetical protein  29.63 
 
 		 271 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3907  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 271 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.869248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3876  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 271 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>