More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1572 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  100 
 
 		 387 aa  793    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 409 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  27.82 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 185 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 719 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 386 aa  93.2  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.12 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  27.59 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  23.84 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  32.32 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.93 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 1201 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  30.61 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  30.61 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  30.61 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  30.61 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  30.61 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.13 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 515 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0644  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.19 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 188 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.16 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  26 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  31.52 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.82 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  28.57 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>